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一种基于群体的置信集推理方法,用于调节数量表型的SNP。 (英语) 兹比尔1351.92031

Choudhary,Pankaj K.(编辑)等,有序数据分析、建模和健康研究方法。为了纪念H.N.Nagaraja的60岁生日。根据2014年3月7日至9日在美国德克萨斯州奥斯汀举行的国际会议上的陈述,选出论文。查姆:施普林格(ISBN 978-3-319-25431-9/hbk;978-3-316-25433-3/电子书)。《Springer Proceedings in Mathematics&Statistics》149,235-244(2015)。
摘要:基于由数十万SNP组成的遗传图谱的全基因组关联研究的使用增加,促使需要可用于初步分析的方法来限制后续研究中调查的SNP数量。我为独立个体介绍了一种置信集推断方法,该方法可作为关联研究的第一步,以推导出一组SNP,这些SNP至少对数量性状的总方差贡献特定的百分比。该方法的主要优点是,它允许控制置信水平,据此可以识别对感兴趣性状的遗传方差具有特定影响的基因。该方法是在线性模型框架内开发的,可以有效地合并有关协变量的信息。我通过在各种简单继承模型下的广泛仿真研究来研究该方法的特性,并将其性能与在软件包Merlin中实现的标准关联方法进行比较。
有关整个系列,请参见[Zbl 1337.92005年].

MSC公司:

92D10型 遗传学和表观遗传学
92B15号机组 普通生物统计学

软件:

梅林SimPed公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
全文: 内政部

参考文献:

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