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Cygan，M。；M.库比卡。；J·拉多舍夫斯基。；W.莱特。；瓦伦，T。

加权LCS问题的多项式时间近似算法。 （英语） Zbl 1335.68304号

离散应用程序。数学。 204, 38-48 (2016).
摘要：我们考虑加权序列的著名最长公共子序列（LCS）问题的一个变体。加权序列确定每个符号出现在序列给定位置的概率（此类序列也称为位置加权矩阵（PWM））。该问题的两种可能版本由A.阿米尔等[J.离散算法8，No.3，273–281（2010；Zbl 1197.68086号)]它们被称为LCWS和LCWS2（最长公共加权子序列1和2）。我们解决了Amir等人[loc.cit.]在论文中提出的一个开放问题，即有界字母表的LCWS2问题的对数概率版本的可处理性，表明对于大小为2的字母表，它已经是NP-hard。我们还改进了Amir等人[loc.cit.]给出的（1/|varSigma|）-近似算法（其中，（varSigma）是字母表）：我们使用（O（n^5）空间给出了LCWS2问题的多项式时间近似方案（PTAS）。对于同一问题，我们也只使用（O（n^2）空间给出了一个更简单的（1/2）-近似算法。

引用于三文件

MSC公司：

68瓦32 字符串上的算法
2017年第68季度 问题的计算难度（下限、完备性、近似难度等）
68周25 近似算法

关键词：

最长公共子序列；加权序列；多项式时间近似格式

引文：

Zbl 1197.68086号

软件：

ClustalW公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{M.Cygan}等人，《离散应用》。数学。204、38-48（2016；Zbl 1335.68304）
全文： 内政部

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