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TreeOfTrees方法用于评估基因树之间的一致性。 (英语) 兹比尔1360.62509

摘要:提出了一种新的方法TreeOfTrees来比较从同一分类群的多组对齐基因序列中获得的X树结构。其目的是检测具有不同进化历史的基因或基因集。树集合之间的比较基于几个树度量,从而得到一个由基因树标记的独特树。其边缘的稳健性值通过自举和一致性程序进行估计,该程序允许检测不同进化的基因子集。在各种演化条件下进行了仿真,以测试该方法的效率,并描述了在实际数据上的应用。还讨论了荫度测试和各种一致性算法。有相应的软件包可用。

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62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
62H30型 分类和区分;聚类分析(统计方面)
68兰特 计算机科学中的图论(包括图形绘制)
62-04 有关统计问题的软件、源代码等
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全文: 内政部

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