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DASACT:公理共识理论的决策辅助软件。 (英语) Zbl 1364.92027号

摘要:已有各种尝试、解决方案和方法来基于一组给定的系统发育树构建合适的共识树。然而,对于实践者来说,对于给定的数据集,哪一个会创建最相关的共识树并不总是很清楚。在本文中,我们介绍了一个名为DASACT(公理共识理论的决策辅助软件)的开源软件,该软件旨在帮助从业者选择最合适的共识函数。它基于公理属性和一致性函数的详尽评估,将知识空间定义为概念格。使用用户提供的公理属性选择,它可以帮助用户选择最合适的函数。DASACT可在以下网站免费获得:http://www.cs.unic.ac.cy/florent/software.htm.

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92D15型 与进化有关的问题
68层37 人工智能背景下的不确定性推理
92-08 生物问题的计算方法
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全文: 内政部

参考文献:

[1] Adams,E.N.,《共识技术和分类树的比较》,系统。动物园。,21, 390-397 (1972)
[2] Adams,E.N.,《N树作为嵌套:复杂性、相似性和一致性》,J.Classif。,3, 299-317 (1986) ·Zbl 0647.62057号
[3] Arnaoudova,E。;霍斯特区。;哈金斯,P。;Jaromczyk,J.W。;摩尔,N。;Schardl,C.L。;Yoshida,R.,使用平均值差异的统计系统发育树分析,Front。神经科学。,4, 47 (2010)
[4] 阿罗,K.J.,《社会选择与个人价值观》(1951),威利出版社:威利纽约·Zbl 0984.91513号
[5] 巴勃,M。;Monjardet,B.,《Ordres et classification:Algèbre et combinetoire》(第二卷)(1970年),哈切特:巴黎哈切特·Zbl 0267.06001号
[6] Barthélemy,J.-P。;麦克莫里斯,F.R。;Powers,R.C.,n树上的独裁共识函数,数学。社会科学。,25, 59-64 (1992) ·Zbl 0779.90002号
[7] Bryant,D.,《系统发育学共识方法的分类》(Janowitz,M.;Lapointe,F.J.;McMorris,F.;Mirkin,B.;Roberts,F.,Bioconsus(2003),DIMACS),163-184·Zbl 1029.05032号
[8] 查伯特,C。;Cherfouh,A。;德拉巴,J.-M。;Duquenne,V.,通过晶格分析评估基因型和表型变量之间的影响,Behav。遗传学。,3125-139(2001年)
[9] 科洛尼乌斯,H。;Schultze,H.H.,《邻近数据的树结构》,英国数学杂志。《心理统计》。,34, 167-180 (1981) ·Zbl 0472.62107号
[10] Day,W.H.E。;McMorris,F.R.,《群体选择和生物数学中的公理共识理论》(2003),暹罗:暹罗费城·Zbl 1031.92001号
[11] 多梅纳奇,F。;Tayari,A.,公理共识属性的含义。《自然与生命的算法》(Lausen,B.;van den Poel,D.;Ultsch,A.,《分类、数据分析和知识组织研究》(2013),Springer-Verlag GmbH:Springer-Verlag GmbH Heidelberg),59-68
[12] Dong,J。;费尔南德斯·巴卡(Fernández-Baca),D。;麦克莫里斯,F.R。;Powers,R.C.,多数规则(+)共识树,数学。Biosci.公司。,228, 10-15 (2010) ·Zbl 1200.92029
[13] Felsenstein,J.,PHYLIP-系统发育推断包(3.2版),分支系统学,5164-166(1989)
[14] 芬登,C.R。;Gordon,A.D.,《获得普通修剪树》,J.Classif。,2, 255-276 (1985)
[15] 甘特尔,B。;Wille,R.,《形式概念分析:数学基础》(1996),Springer·Zbl 0861.06001号
[16] Haeckel,E.,Generelle Tomographie der Organismen(1866年),G.Reimer:G.Reimer Berlin
[18] Margush,T。;McMorris,F.R.,共识n树,公牛。数学。生物学,43,239-244(1981)·Zbl 0455.92019号
[19] Nelson,G.,《分支分析与合成:原理与定义》,附阿登森《植物家族》(1763-1764)的历史注释,系统。动物园。,28, 1-21 (1979)
[20] Neumann,D.A.,n树的忠实一致性方法,数学。Biosci.公司。,63, 271-287 (1983) ·Zbl 0539.62073号
[21] 佩奇,R.D.M.,《对极中的轨迹和树:对汉弗莱斯和塞伯格的回复》,Syst。祖尔。,39, 288-299 (1990)
[22] Page,R.D.M.,《组件用户手册》(1993),自然历史博物馆:伦敦自然历史博物馆,2.0版
[23] Pareto,V.,《政治经济学》(1896),F.Rouge:F.Rouge洛桑
[24] 菲利普斯,C。;Warnow,T.J.,《不对称中间树——构建共识树的新模型》,Disc。应用程序。数学。,71, 311-335 (1996) ·兹伯利0868.92017
[25] Poelmans,J。;埃尔津加,P。;Viaene,S。;Dedene,G.,《正式分析家庭暴力的概念》,专家系统。申请。,38, 3116-3130 (2011)
[26] Saari,D.G.,《处置独裁者,解密投票悖论》(2008),剑桥大学出版社·Zbl 1168.91007号
[27] Schröder,R.E.,Vier组合问题,Z.数学。物理。,15, 361-376 (1870) ·JFM 02.0108.04版
[28] Sertkaya,B.,OntoComP:一个用于完成OWL本体的protégéplugin,Semant。网址:Res.Appl。,5554, 898-902 (2009)
[29] Sholander,M.,《中位数、格子和树》(美国数学学会学报,5(1954)),808-812·Zbl 0056.26201号
[30] 斯皮林,M。;威尔金森,H。;布兰肯希普,J。;Schardl,C.,通过真菌内生新伤寒菌uncinatum,fungal Genet表达与棒棒糖生物碱表达相关的序列标签和基因。《生物学》,36,242-254(2002)
[31] Sokal,R.R。;Rohlf,F.J.,《重新检查轻足类的分类一致性》,系统。动物园。,30, 309-325 (1981)
[32] Swofford,D.L.,PAUP:使用Parsimony进行系统发育分析(1990),《伊利诺伊州自然历史调查:伊利诺伊自然历史调查-香槟》,3.0版
[33] 威尔金森,M。;Thorley,J.L。;Pisani,D.E。;拉波因特,F.-J。;麦金纳尼;James,O.,《自由超树的一些迫切需要》,《系统发生超树:结合信息揭示生命之树》,564-582(2004),Kluwer学术出版社
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