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林志祥；斯蒂芬·桑德斯。；李明峰；内纳德·塞斯坦；州政府，马修·W。；赵宏宇

基于马尔可夫随机场的方法，利用时空转录组数据表征人脑发育。 （英语） Zbl 1454.62352号

附录申请。斯达。 9，第1期，429-451（2015）.
摘要：人类神经发育是一个高度调控的生物过程。在本文中，我们通过分析人脑微阵列数据来研究神经发育的动态变化，这些数据来自于15个神经发育时期的16个脑区。我们开发了一个两步推断程序来识别表达和未表达的基因，并检测相邻时间段之间差异表达的基因。在我们的方法中，马尔可夫随机场（MRF）模型被用来有效地利用嵌入在大脑区域相似性和时间依赖性中的信息。我们开发并实现了一种蒙特卡罗期望最大化（MCEM）算法来估计模型参数。仿真研究表明，与不考虑空间相似性和时间依赖性的模型相比，我们的方法实现了更低的误分类错误和潜在的功率增益。

引用于4文件

MSC公司：

62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析
62M40型 随机字段；图像分析

关键词：

马尔可夫随机场模型；时空数据；神经发育；微阵列；蒙特卡罗期望最大化算法；基因表达；差异表达

软件：

戴维
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit｛Z.Lin｝等人，Ann.Appl。Stat.9，No.1，429--451（2015；Zbl 1454.62352）
全文： 内政部 arXiv公司 欧几里得

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