×
马克西姆·勒诺曼;弗兰克·贾博特;纪尧姆·Deffuant

复杂模型的自适应近似贝叶斯计算。 （英语） Zbl 1306.65088号

计算。斯达。 28，第6期，2777-2796（2013）.
摘要：我们提出了一种新的近似贝叶斯计算（ABC）算法，旨在最小化模型运行次数，以达到给定的后验近似质量。该算法自动确定其公差水平的顺序，并使用易于解释的停止准则。此外，它避免了在使用MCMC内核时发现的粒子复制问题。当应用于玩具示例和复杂的社会模型时，我们的算法比当前可用的三种主要顺序ABC算法快2-8倍。

引用于16文件

MSC公司：

62-08 统计问题的计算方法

关键词：

基础知识;人口蒙特卡罗;序贯蒙特卡罗

软件：

R（右）;ABC工具箱;左侧（lhs）;EasyABC公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{M.Lenormand}等人，计算。Stat.28，No.6，2777--2796（2013；Zbl 1306.65088）
全文： 内政部 arXiv公司

参考文献：

[1] Beaumont MA（2010）进化与生态学中的近似贝叶斯计算。Annu Rev Ecol Evol系统41（1）：379-406·Zbl 1217.62128号
[2] Beaumont MA、Cornuet J、Marin J、Robert CP（2009）自适应近似贝叶斯计算。生物特征96（4）：983-990·Zbl 1437.62393号
[3] Beaumont MA，Zhang W，Balding DJ（2002），人口遗传学中的近似贝叶斯计算。遗传学162（4）：2025-2035
[4] Blum MGB，François O（2010）近似贝叶斯计算的非线性回归模型。统计计算20（1）:63-73·doi:10.1007/s11222-009-9116-0
[5] Carnell R（2009）lhs:拉丁超立方体样本。R包版本0.5
[6] Del Moral P、Doucet A、Jasra A（2006）《序贯蒙特卡罗采样器》。J R Stat Soc Ser B Stat方法68（3）：411-436·Zbl 1105.62034号 ·文件编号：10.1111/j.1467-9868.2006.00553.x
[7] Del Moral P，Doucet A，Jasra A（2012）一种用于近似贝叶斯计算的自适应序列蒙特卡罗方法。统计计算22（5）：1009-1020·Zbl 1252.65025号 ·doi:10.1007/s11222-011-9271-y
[8] Drovandi CC，Pettitt AN（2011）使用近似贝叶斯计算估算大型寄生虫种群进化参数。生物统计学67（1）：225-233·Zbl 1217.62128号 ·文件编号：10.1111/j.1541-0420.2010.01410.x
[9] Fearnhead P，Prangle D（2011），为近似贝叶斯计算构建汇总统计：半自动ABC。技术报告1004.1112。arXiv.org网站·Zbl 1411.62057号
[10] Filippi S，Barnes C，Stumpf MPH（2012）关于使用序列蒙特卡罗进行近似贝叶斯计算的核的最优性。arXiv:1106.6280v4型
[11] Glynn P，Whitt W（1992）模拟估计器的渐近效率。运营研究40（3）：505-520·Zbl 0760.62009号 ·doi:10.1287/opre.40.3.505
[12] Huet S，Deffuant G（2011）主要项目中微观模拟模型的通用框架。技术报告，Cemagref LISC
[13] Jabot F，Faure T，Dumoulin N（2013）EasyABC：使用R.Methods Ecol Evol.（出版）执行有效的近似贝叶斯计算抽样方案。doi:10.1111/2041-210X.12050·Zbl 1252.65025号
[14] Joyce P，Marjoram P（2008）近似充分统计和贝叶斯计算。统计应用基因分子生物学7（1）：1-18·Zbl 1276.62077号
[15] Marjoram P、Molitor J、Plagnol V、TavaréS（2003）《无可能性的马尔可夫链蒙特卡罗》。美国国家科学院院刊100（26）：15324-15328·doi:10.1073/pnas.0306899100
[16] R开发核心团队（2011）R：统计计算的语言和环境。奥地利维也纳R统计计算基金会，ISBN 3-900051-07-0
[17] Sisson SA、Fan Y、Tanaka MM（2007）《无可能性的连续蒙特卡罗》。美国国家科学院院刊104（6）：1760-1765·Zbl 1160.65005号 ·doi:10.1073/pnas.0607208104
[18] Toni T，Welch D，Strelkowa N，Ipsen A，Stumpf MPH（2009）动力学系统中参数推断和模型选择的近似贝叶斯计算方案。J R Soc接口6:187·doi:10.1098/rsif.2008.0172
[19] Wegmann D，Leuenberger C，Excoffier L（2009）高效近似贝叶斯计算与无似然马尔可夫链蒙特卡罗耦合。遗传学182（4）：1207-1218·doi:10.1534基因109.102509
[20] Wegmann D、Leuenberger C、Neuenschwander S、Excoffier L（2010）Abctoolbox：一个用于近似贝叶斯计算的通用工具包。BMC生物信息学11（1）：116·doi:10.1186/1471-2105-11-116
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。