郑玲玲;燕，肖;苏尼尔·苏欣德兰;霍莉·德雷斯曼;约翰·P·丘特（John P.Chute）。;约瑟夫·卢卡斯 通过贝叶斯综合建模进行生物路径选择。 （英语） Zbl 1296.92081号 统计应用程序。遗传学。分子生物学。 13，第4期，435-457（2014）. 小结：通路分析已成为了解差异表达基因潜在生物学的一种中心方法。由于公共存储库中积累了大量微阵列数据，因此需要灵活的方法来扩展简单病例对照研究的分析，以便将其与大量可用且高度异构的数据集联系起来。为了应对这一挑战，我们开发了一个两级模型，包括1）一个联合贝叶斯因子模型，该模型集成了多个微阵列实验，并将每个因子与预定义的路径联系起来；2）一个点-质量混合分布，该分布推断出哪些因子与每个数据集相关/无关。我们的方法可以识别特定实验性状的特定通路，这些通路在多种干预下同时被诱导/抑制。在本文中，我们深入描述了该模型，并提供了其在模拟中的应用示例以及辐射暴露研究的实际数据。我们对辐射研究的分析使我们对小鼠外周血电离辐射的时间和剂量依赖性反应的分子基础有了新的见解。这个广泛适用的模型为以路径为中心的方式生成特定和可测试的假设提供了一个起点。 引用于1审查 MSC公司： 92B15号机组 普通生物统计学 关键词：贝叶斯联合因子分析;通路分析;基因表达;综合分析;辐射研究 软件：MSigDB公司;KEGG公司;GSVA公司;戴维 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{L.Zheng}等人，《统计应用》。遗传学。分子生物学。13，第4号，435--457（2014；Zbl 1296.92081） 全文： 内政部 参考文献： [1] Beier，U.H.，L.Wang，T.R.Bhatti，Y.Liu，R.Han，G.Ge和W.W.Hancock（2011）：“Sirtuin-1靶向促进Foxp3+T调节细胞功能并延长移植物存活时间，”鼹鼠。细胞。生物学，311022-1029。； [2] Bhattacharya，A.和D.B.Dunson（2011）：“稀疏贝叶斯无限因子模型”，《生物统计学》，98，291-306·Zbl 1215.62025号 [3] Buxant，F.、D.Bucella、V.Anaf、P.Simon和J.C.Noöl（2009）：“宫颈上皮内瘤变和宫颈浸润性鳞癌中糖皮质激素受体的表达”，《欧洲妇科杂志》。Oncol.公司。，30, 259-262.; 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