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通过自动机操作获得的成对有理核。 (英语) 兹比尔1302.68178

Holzer,Markus(编辑)等人,《自动机的实现和应用》。2014年7月30日至8月2日,第19届国际会议,CIAA 2014,德国吉森。诉讼程序。柏林:施普林格出版社(ISBN 978-3-319-08845-7/pbk)。计算机科学课堂讲稿8587,332-345(2014)。
摘要:成对有理核(PRK)是处理两对实体之间相似性的成对核和基于有限状态变换器处理序列数据的有理核的组合。PRK已经用于生物信息学问题,例如代谢网络预测,以减少存储和处理方面的计算成本。
在本文中,我们基于自动机和换能器操作提出了新的两两有理核。在这种情况下,我们对自动机对定义了新的操作,以获得新的有理核。我们利用这些新的PRK进行实验,以预测代谢网络。因此,当我们将它们与以前的内核进行比较时,我们获得了更好的准确性和执行时间。
关于整个系列,请参见[Zbl 1293.68026号].

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第68季度第45季度 形式语言和自动机
92立方厘米 系统生物学、网络

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全文: 内政部