埃齐奥·巴托西;弗拉维奥·科拉迪尼;伊曼纽拉·梅雷利;卢卡·特塞 模型检查生物振荡器。 (英语) 兹比尔1283.92008 尼古拉·卡纳塔(编辑)等人,《第二次研讨会论文集——从生物学到并发性再到并发性(FBTC 2008)》,冰岛雷克雅未克,2008年7月12日。阿姆斯特丹:爱思唯尔。理论计算机科学电子笔记229,第1期,41-58(2009)。 摘要:我们定义了时间自动机的一个子类,称为振荡器时间自动机,适用于模拟生物振荡器。介绍了它们相互作用的语义,即参数w.r.t.同步模型。我们将其应用于Kuramoto模型。然后,我们引入了一种逻辑,即Kuramoto同步逻辑(KSL)和一种模型检查算法,以验证耦合振荡器群的集体同步特性。有关整个系列,请参见[Zbl 1278.92003号]. 引用于2文件 MSC公司: 92B20型 生物研究、人工生命和相关主题中的神经网络 65年第68季度 形式语言和自动机 60年第68季度 规范和验证(程序逻辑、模型检查等) 关键词:自发同步;Kuramoto模型;振荡器定时自动机;KSL公司;模型检查 软件:StonyCam公司 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{E.Bartocci}等人,《电子》。注释Theor。计算。科学。229,第1号,41-58(2009;Zbl 1283.92008) 全文: 内政部 参考文献: [1] Acebron,J。;博尼拉,L。;佩雷斯·维森特,C。;Ritort,F。;Spigler,R.,《Kuramoto模型:同步现象的简单范例》,Rev.Mod。物理。,77137-185(2005年) [2] 阿鲁尔(Alur,R.)。;Dill,D.L.,《时间自动机理论》,理论计算机科学,126183-235(1994)·Zbl 0803.68071号 [3] 阿鲁尔(Alur,R.)。;Henzinger,T.A.,《真正的时间逻辑》,《ACM杂志》,第41期,第181-203页(2004年)·Zbl 0807.68065号 [4] Bartocci,E。;Corradini,F。;格罗苏,R。;梅雷利,E。;斯莫尔卡,S。;Riganelli,O.,StonyCam:建模、分析和调节心肌细胞的正式框架,(计算机科学讲稿(2008),Springer-Verlag),493-502·兹比尔1143.92316 [5] Bartocci,E。;Corradini,F。;梅雷利,E。;Tesei,L.,KSL模型检查器和模拟器原型,URL [6] Buck,J.,《萤火虫的同步节律闪烁II》,《生物学季刊》,第63期,第265-289页(1988年) [7] Butcher,J.C.,《常微分方程的数值方法》(2003),John Wiley and Sons·Zbl 1040.65057号 [8] Dye,J.,《脑干振荡器背后的离子和突触机制:对适配子起搏器核的体外研究》,《比较生理学杂志》,168,521-532(1991) [9] Henzinger,T.A。;尼克林,X。;Sifakis,J。;Yovine,S.,实时系统的符号模型检查,信息与计算,111,193-244(1994)·Zbl 0806.68080号 [10] Kitano,H.,《系统生物学基础》(2002),麻省理工学院出版社 [11] Kuramoto,Y.,《弱不稳定周期结构的相动力学:凝聚物质和统计物理》,《理论物理进展》,711182-1196(1984)·Zbl 1046.76502号 [12] Kuramoto,Y.,脉冲耦合振荡器和可激发单元的集体同步,《物理学D》,50,15-30(1991)·Zbl 0736.92001号 [13] Kuramoto,Y.,《化学振荡、波浪和湍流》(2003),Springer-Verlag·Zbl 0558.76051号 [14] 米罗洛·R·E。;Strogatz,S.H.,脉冲耦合生物振荡器的同步,SIAM应用数学杂志,501645-1662(1990)·Zbl 0712.92006号 [15] Peskin,C.S.,《心脏生理学的数学方面》(1975年),纽约大学Courant数学科学研究所:纽约大学Courant数学科学研究所·Zbl 0301.92001 [16] Strogatz,S.H.,SYNC,《自发秩序的新兴科学》(2004),Hyperion [17] 王,R。;Chen,L。;Aihara,K.,《通过外部输入同步多细胞系统:人工控制策略》,生物信息学,221775-1781(2006) [18] Winfree,A.T.,《生物节律和耦合振荡器种群的行为》,《理论生物学杂志》,16,15-42(1967) 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。