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高维贝叶斯参数估计:JAK2/STAT5信号模型的案例研究。 (英语) Zbl 1284.62174号

摘要:在这项工作中,我们给出了用于分析常微分方程模型的详细贝叶斯参数估计的结果。这些取决于必须从实验数据中推断出的许多未知参数。然而,高维参数空间中的统计推断在概念上和计算上都具有挑战性。为了确保对模型和预测不确定性进行严格评估,我们利用了剖面后验方法和马尔可夫链蒙特卡罗抽样。
我们分析了包含100多个参数的JAK2/STAT5信号转导通路的动力学模型。使用后向剖面,我们发现相应的后向分布是双峰的。为了保证在存在多峰后验分布的情况下有效混合,我们应用了多链采样方法。贝叶斯参数估计可以评估预测的不确定性,并设计额外的实验来增强模型的解释力。
这项研究证明了用于系统生物学定量动力学建模的详细统计分析在高维参数空间中也是可行的。

MSC公司:

2015年1月62日 贝叶斯推断
10层62层 点估计
92C40型 生物化学、分子生物学
第92页第42页 系统生物学、网络
92立方37 细胞生物学
65立方厘米 马尔可夫链的数值分析或方法
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
全文: 内政部

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