朱,沙;钢铁,迈克 随机树谜题在多个分类单元限制内产生Yule-Harding树吗? (英语) 兹比尔1310.92040 数学。Biosci公司。 243,第1期,109-116(2013). 摘要:有人提出,当分类群数量变大时,随机树谜题(RTP)过程会导致Yule-Harding(YH)分布。在本研究中,我们形式化了这个猜想,并证明了两个树分布对于两个特定的属性收敛,这表明该猜想可能是真的。然而,我们提供的统计证据表明,虽然这两种分布很接近,但RTP似乎收敛于与YH不同的分布。通过对比,在结论部分中,我们显示了应用于随机两状态数据的最大简约方法在树上导致了非常不同的(PDA或均匀)分布。 引用于1文件 MSC公司: 92D15型 与进化有关的问题 92D10型 遗传学和表观遗传学 05C90年 图论的应用 60二氧化碳 组合概率 关键词:系统发育树;树拼图;保利亚恩;质心顶点 软件:PhyML(物理建模语言);fastDNAml(快速DNAml) PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{S.Zhu}和\textit{M.Steel},数学。Biosci公司。243,编号1,109--116(2013;Zbl 1310.92040) 全文: 内政部 参考文献: [1] Bagchi,A。;Pal,A.K.,广义Polya-Eggenberger urn模型中的渐近正态性,及其在计算机数据结构中的应用,SIAM代数和离散方法杂志,6394(1985)·Zbl 0568.60010号 [2] 道宾,V。;Ochman,H.,《细菌基因组中的四方定位和横向转移程度》,分子生物学与进化,1986(2004) [3] 连衣裙,A。;von Haeseler,A。;Krueger,M.,使用“四点条件”变体重建系统发育树,Studien zur Klassifikation,17299(1986) [4] Felsenstein,J.,DNA序列的进化树:最大似然方法,分子进化杂志,17368(1981) [5] Guindon,S。;杜法亚德,J.F。;勒福特,V。;Anisimova,M。;Hordijk,W。;Gascuel,O.,估计最大似然系统发育的新算法和方法:评估PhyML 3.0的性能,系统生物学,59307(2010) [6] Guindon,S。;Gascuel,O.,《通过最大似然估计大型系统发育的简单、快速和准确算法》,《系统生物学》,52,696(2003) [7] Hoeffing,W.,有界随机变量和的概率不等式,美国统计协会杂志,58,13(1963)·Zbl 0127.10602号 [8] Jordan,C.,《木制品组合》,《Reine und Angewandte Mathematik杂志》,70185(1869) [9] A.N.C.康。;Ault,D.A.,自由树质心的一些性质,《信息处理快报》,4,18(1975)·Zbl 0313.68032号 [10] Karr,A.F.,《概率》(1993),《斯普林格·弗拉格:纽约斯普林格尔·弗拉格》·Zbl 0784.60001号 [11] 科茨,S。;Balakrishnan,N。;Johnson,N.L.,《连续多元分布,模型与应用》,第1卷(2000年),Wiley:Wiley New York·兹比尔0946.62001 [12] Mahmoud,H.,Pólya Urn Models(2008),查普曼和霍尔/CRC:查普曼与霍尔/CRC博卡拉顿·Zbl 1149.60005号 [13] McKenzie,A。;Steel,M.,两种树木模型的樱桃分布,数学生物科学,164,81(2000)·兹比尔0947.92021 [14] Mitchell,S.L.,树形心的另一个特征,离散数学,24277(1978)·Zbl 0402.05019号 [15] Nieselt-Struwe,K。;von Haeseler,A.,四元映射,相似映射程序的概括,分子生物学与进化,71204(2001) [16] 施密特,H.A。;斯特里默,K。;温格伦,M。;von Haeseler,A.,TREE-PUZZLE:使用四分位和并行计算的最大似然系统发育分析,生物信息学,18502(2002) [17] Semple,C。;Steel,M.,《系统发生学》(2003),牛津大学出版社:牛津大学出版社,英国牛津·Zbl 1043.92026 [18] Smythe,R.T.,urn模型的中心极限定理,随机过程及其应用,65,115(1996)·Zbl 0889.60013号 [19] Steel,M.A.,《由简约原理产生的双色二叉树上的分布》,《离散应用数学》,43,245(1993)·Zbl 0777.05046号 [20] 斯特里默,K。;Goldman,N。;von Haeseler,A.,贝叶斯概率和四重奏困惑,分子生物学与进化,2210(1997) [21] 斯特里默,K。;von Haeseler,A.,《四重奏的困惑:重建树拓扑的四重奏最大似然方法》,分子生物学与进化,13,7,964(1996) [22] Vinh,L.S.公司。;Fuehrer,A。;von Haeseler,A.,《随机树谜题导致Yule-Harding分布》,分子生物学与进化,28873(2011) 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。