秦丽轩;萨塔戈潘(Jaya M.Satagopan)。 异质样本转录研究的标准化方法——同时阵列标准化和等效表达的识别。 (英文) Zbl 1276.62087号 统计应用程序。遗传学。分子生物学。 8,第1号,第10条,23页(2009年). 摘要:归一化是转录谱微阵列数据分析中的一个重要步骤,因为任何转录谱实验中涉及的多个步骤都会产生系统的非生物变化。现有的数据规范化方法通常假设微分表达式很少或对称,但这种假设并不总是成立的。或者,非差异表达基因可用于阵列标准化。然而,从一开始就不知道哪些基因是非差异表达的。本文提出了一个层次混合模型框架,用于同时识别非差异表达基因并使用这些基因对阵列进行归一化。推导了阵列效应对应的Fisher信息矩阵,为阵列归一化方法的选择提供了有用的直观性。使用模拟数据评估了该方法的操作特性。在多种参数配置下进行的仿真表明,该方法为阵列归一化提供了一种有用的替代方法。例如,在差异表达基因的适度流行情况下,以及当过表达和低表达的程度不相同时,所提出的方法比中值归一化具有更好的灵敏度。此外,当差异表达基因的流行率很低时,该方法具有类似于中位数归一化的特性。通过使用MSKCC的脂肪肉瘤研究来确定正常脂肪组织和脂肪肉癌组织样本之间差异表达的基因,提供了该方法的实证说明。 MSC公司: 62页第10页 统计学在生物学和医学科学中的应用;元分析 92D10型 遗传学和表观遗传学 关键词:基因表达;归一化;混合物模型;费希尔信息 软件:电子束阵列 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{L.-X.Qin}和\textit{J.M.Satagopan},统计应用。遗传学。分子生物学。8,第1号,第10条,第23页(2009年;Zbl 1276.62087) 全文: 内政部 链接