李川;李，林;玛哈丽塔·佩图赫;埃米尔·阿列克索夫 泊松-玻耳兹曼方程求解器的开发进展。 （英文） Zbl 1277.65086号 基于摩尔的数学。生物。 1, 42-62 (2013). 摘要：这篇综述概述了在开发更准确、高效的解决方案来模拟由生物大分子和纳米物体组成的系统中的静电方面取得的最新进展，最后一个是指那些本身不具有生物功能的物体，但现在经常与生物大分子一起用于生物物理和医学方法。从两个不同的角度回顾了高分子静电建模问题：作为一项数学任务，提供了待建模系统的具体定义；作为一个物理问题，旨在更好地捕捉实际实验中发生的现象。此外，还特别关注扩展现有求解器的能力以模拟大型系统的方法，以应用于计算分子马达、线粒体复合体、光合机械和涉及大型纳米物体的系统中的静电势和能量。 引用于5文件 MSC公司： 65号06 含偏微分方程边值问题的有限差分方法 65号38 偏微分方程边值问题的边界元方法 68瓦10 计算机科学中的并行算法 92-08 生物学相关问题的计算方法 92C05型 生物物理学 92C40型 生物化学、分子生物学 关键词：连续静电学;泊松-玻耳兹曼方程;数值技术;介电常数;分子表面 软件：超高bd;格鲁马克斯;NAMD公司;APBS公司;FFTSVD公司;查姆;AFMPB公司;阿普斯梅姆;TMSmesh公司;德尔菲;新加坡;MIBPB公司 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{C.Li}等人，基于分子的数学。生物学1，42--62（2013；Zbl 1277.65086） 全文： 内政部 参考文献： [1] M.J.Abraham和J.E.Gready，《使用GROMACS 4.5中的光滑粒子-米什-埃瓦尔德优化分子动力学模拟参数》，《计算化学杂志》32（2011），第2031-2040页。 [2] N.Adir等人，《球形红杆菌光合作用反应中心-细胞色素c2复合物的共结晶和表征》，《生物化学》35（1996），第2535-47页·doi:10.1021/bi9522054 [3] B.Aksoylu等人，《Poisson-Boltzmann方程的面向目标适应性和多级预处理》，《科学计算杂志》（2012），第1-24页·Zbl 1263.78011号 ·doi:10.1007/s10915-011-9539-6 [4] 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