×
弗朗索瓦·布里尔；马克·勒弗朗克；弗朗索瓦·莱梅尔；默兰特，皮埃尔·伊曼纽尔

使用消除法对化学反应系统进行模型简化。 （英文） 1270.92025兹罗提

数学。计算。科学。 5，第3号，289-301（2011）.
摘要：对于由化学反应系统产生的参数常微分系统，存在不同的模型降阶方案。我们重点讨论了一些依赖于准静态近似的方案。我们证明了这些格式可以通过微分和代数消元法来表示。我们的公式比经典公式简单。它使我们获得了一个与亨利·米查·曼顿和布里格斯·哈丹不同的基本酶反应体系的近似值。

引用于7文件

MSC公司：

92C45型 生化问题中的动力学（药代动力学、酶动力学等）
34C60个 常微分方程模型的定性研究与仿真
37N25号 生物学中的动力系统

关键词：

准稳态近似；计算机代数；微分代数；化学反应系统

软件：

艾司隆；罗达斯；正则链；叶片；微分代数
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit｛F.Boulier｝等人，数学。计算。科学。5，第3号，289--301（2011；Zbl 1270.92025）
全文： 内政部 哈尔

参考文献：

[1] Bellon，B.：Biochimie structure:引言a la cinétique enzomatique（2006）（法语）。http://www.up.univ-mrs.fr/wabim/d_agora/d_biochimie/cinetique.pdf
[2] Bennet M.R.、Volfson D.、Tsimring L.、Hasty J.：基因调控网络的瞬态动力学。生物物理学。J.92，3501–3512（2007）·doi:10.1529/biophysj.106.095638
[3] Boulier，F.：2006年5月，《生命科学应用中不同多项式系统的代数标准》。梅莫伊尔·达维利塔伊·迪里格尔（Mémoire d'habilitationádiriger des recherches）。里尔大学I，LIFL，59655 Villeneuve d'Ascq，France。http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00137153
[4] Boulier，F.：差异消除和生物建模。计算和应用数学氡系列（Gröbner Bases in Symbolic Analysis）2，pp.111-139（2007）。http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00139364 ·Zbl 1131.92002号
[5] Boulier，F.、Lazard，D.、Ollivier，F.和Petitot，M.：有限生成微分理想根的表示。载于：ISSAC’95：1995年符号和代数计算国际研讨会论文集，第158–166页。ACM出版社，纽约（1995年）。http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00138020 ·Zbl 0911.13011号
[6] Boulier F.，Lazard D.，Ollivier F.，Petitot M.：有限生成微分理想根的计算表示。申请。代数工程通讯。计算20（1），73–121（2009）（1997年LIFL技术代表IT306）·Zbl 1185.12003年 ·doi:10.1007/s00200-009-0091-7
[7] Boulier，F.、Lefranc，M.、Lemaire，F.和Morant，P.-E.：应用严格的准稳态近似方法证明遗传电路模型中不存在振荡。摘自：Horimoto，K.等人（编辑），《代数生物学学报》2008年第5147期，LNCS，第56-64页。柏林施普林格出版社（2008）·Zbl 1171.92317号
[8] Boulier，F.、Lefranc，M.、Lemaire，F.，Morant，P.-E、Urgüplü，A.：关于证明遗传回路模型中不存在振荡的问题。收录于：Anai，K.H.H.，Kutsia，T.（编辑）《代数生物学学报》，LNCS，第4545卷，第66-80页。施普林格，柏林（2007）。http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00139667 ·Zbl 1127.92306号
[9] Boulier，F.，Lemaire，F.：计算正则微分理想的正则代表。摘自：ISSAC’00《2000年符号和代数计算国际研讨会论文集》，第38-47页。ACM出版社，纽约（2000年）。http://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00139177 ·Zbl 1326.68344号
[10] Boulier，F.，Lemaire，F.：正则微分链的标准形算法。数学。计算。科学。4（2），185-201（2010）doi:10.1007/s11786-010-0060-3·Zbl 1218.68202号
[11] Briggs，G.E.，Haldane，J.B.S.：关于酶作用动力学的注释。生物化学。J.19338–339（1925年）。在上可用http://www.biochemj.org/bj/019/0338/bj0190338_browse.htm
[12] Crampin E.J.、Schnell S.、Mac Sharry P.E.：推导复杂生化反应机制的数学和计算技术。掠夺。生物物理学。分子生物学。86, 77–112 (2004) ·doi:10.1016/j.pbiomolbio.2004.04.002
[13] Hairer E.，Wanner G.：求解常微分方程II刚性和微分代数问题，计算数学第14卷第2版Springer系列。施普林格，纽约（1996）·兹比尔0859.65067
[14] 亨利五世：Lois générales de l’Action des Diastases。赫尔曼，巴黎（1903）
[15] Horn F.，Jackson R.：一般质量作用动力学。架构（architecture）。定额。机械。分析。47, 81–116 (1972)
[16] 休伯特女士：微分代数中的无因式分解算法。J.塞姆。计算。29(4–5), 641–662 (2000) ·兹比尔0984.12004 ·doi:10.1006/jsco.1999.0344
[17] Kell D.B.和Knowles J.D.：系统生物学中建模的作用。摘自：Szallasi，Z.、Stelling，J.、Periwal，V.（编辑）《细胞生物学中的系统建模：从概念到螺母和螺栓》，第3-18页。麻省理工学院出版社，剑桥（2006）
[18] Klamt S.，Stelling J.：化学计量和基于约束的建模。摘自：Szallasi，Z.、Stelling，J.、Periwal，V.（编辑）《细胞生物学中的系统建模：从概念到螺母和螺栓》，第73-96页。麻省理工学院出版社，剑桥（2006）
[19] Kolchin E.R.：微分代数和代数群。纽约学术出版社（1973）·兹伯利0264.12102
[20] Lemaire，F.、Moreno Maza，M.、Xie，Y.：MAPLE 10中的RegularChains库。收录于：Kotsireas，I.S.（编辑）《MAPLE会议》，第355-368页（2005年）·Zbl 1114.68628号
[21] Michaelis，L.，Menten M.：Die kinetik der invertinwirkung。生物化学Zeitschrift 49，333–369（1973）（英文部分翻译http://web.lemoyne.edu/\（\sim\）giunta/menten.html）
[22] Morant，P.-E.，Vandermoere，C.，Parent，B.，Lemaire，F.，Corellou，F..，Schwartz，C.，Bouget，F.-Y.，Lefranc，M.：简单的振荡器。应用程序a l’horloge circadienne d'une algue unicellulaire。摘自：《巴黎非莱茵之争会议录》（2007年）。http://nonlinearie.univ-lille1.fr
[23] 牛伟：用代数方法对生物系统进行定性分析。巴黎第六大学博士论文，巴黎，2011年6月。
[24] Okino M.S.，Mavrovouniotis M.L.：化学反应系统数学模型的简化。化学。修订版98（2），391-408（1998）·doi:10.1021/cr950223l文件
[25] Ritt J.F.：微分代数。多佛出版公司，纽约（1950）·Zbl 0037.18402号
[26] Sedoglavic，A.：通过校正代数参数系统的仿射扩展Lie对称性来简化代数参数系统。收录：Anai，K.H.H.，Kutsia，T.（编辑）《2007年代数生物学学报》，LNCS，第4545卷，第277-291页（2007）·Zbl 1333.34055号
[27] Van Breusegem，V.，Bastin，G.：反应系统的降阶动力学建模：奇异摄动方法。摘自：第30届IEEE决策与控制会议记录（英国布莱顿，1991年12月），第1049–1054页
[28] Vilar，J.M.G.，Kueh，H.Y.，Barkai，N.，Leibler，S.：基因振荡器中的抗噪声机制。载：《美国国家科学院院刊》99，第9卷，第5988–5992页（2002年）
[29] Vora N.，Vora N.:化学反应系统的非线性模型简化。AIChE J.45（10），2320–2332（2001）·数字对象标识代码：10.1002/aic.690471016
[30] Wang D.：淘汰实践：软件工具和应用程序。帝国理工学院出版社，伦敦（2003）
[31] Wang，D.，Xia，B.：具有实际溶液分类的生物系统稳定性分析。摘自：《2005年国际社会科学院学报》，第354-361页，北京（2005）·Zbl 1360.92048号
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。