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用无关个体样本进行人类遗传关联研究时控制种群结构。 (英语) Zbl 1245.62148号

摘要:在遗传学研究中,基因型和表型之间的关联可能会因未被识别的群体结构和/或混合物而混淆。研究表明,即使在被认为相对同质的欧洲人口中,也存在人口分层,并可能影响关联研究的有效性。近年来,已经提出了许多方法来解决这个问题。其中,基于混合模型的方法和基于主成分的方法与其他方法相比具有一些优势。然而,这些方法尚未在大型人类数据集上进行彻底评估。本研究的目的是(1)评估和比较混合模型方法和基于主成分的方法在使用由无关个体组成的人类数据进行遗传关联映射时的性能,以及(2)了解这两种方法之间的关系。为了实现这些目标,我们在各种场景下基于HapMap数据模拟数据集。我们的结果表明,混合模型方法在控制种群结构/混合方面表现良好。它的性能与基于主成分分析的性能相似。然而,混合模型和主成分分析相结合的方法并没有这两种方法本身表现得好。

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62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
92D10型 遗传学和表观遗传学
62H25个 因子分析和主成分;对应分析

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