×

寻找新的共享物种时的顺序采样。 (英语) Zbl 1300.62058号

摘要:在微生物科学以及其他学科中,为了确定群落的结构或相似性,以顺序或分组顺序的方式对群落进行采样通常很有价值。为了实现这一点,我们开发了序贯抽样程序,首先假设每次从每个群体中抽取一个观察值并进行替换。假设在发现(n)对观测值和(k)个共享物种后终止采样,并假设我们获得回报(h(k)-cn),其中(h(k)为非递减,采样成本(c)为非负。类似于[S.L.拉斯穆森N.斯塔尔《美国统计协会期刊》第74卷第661页至第667页(1979年;Zbl 0421.62066号)]证明了当h(k+1)-h(k)为非递增时,存在最优停止规则。类似的结果适用于分组顺序采样。这导致使用发现新共享物种的概率的估计值作为停止指标,以根据相似性指数比较两个种群。我们通过仿真和实例表明,这是一种可行的方法,可以帮助减少样本量。

MSC公司:

62升15 统计中的最佳停止
第62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析

软件:

DOTUR公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
全文: 内政部

参考文献:

[1] 邦吉,J。;Fitzpatrick,M.,《物种数量估算:综述》,《美国统计协会杂志》,88,364-373(1993)
[2] 赵,A。;黄,W。;陈,Y。;Kuo,C.,估算两个群落中共享物种的数量,中国统计局,10227-246(2000)·兹比尔1010.62106
[3] 赵,A。;马,M。;Yang,M.C.K.,在不同检测率下重新捕获调试的停止规则和估计,Biometrika,80193-201(1993)·Zbl 0770.62069号
[4] 赵,A.,《关于估计发现新物种的可能性》,《统计年鉴》,第9卷,第1339-1342页(1981年)·Zbl 0477.62016
[5] 克莱顿,M.K。;Frees,E.W.,发现新物种概率的非参数估计,《美国统计协会杂志》,82305-311(1987)·Zbl 0612.62060号
[6] 埃夫隆,B。;Thisted,R.,估算未发现物种的数量:莎士比亚知道多少单词?,《生物特征》,63,435-447(1976)·Zbl 0344.62088号
[7] Esty,W.W.,钱币学家使用的占有率问题估计器的置信区间,数学科学家,9,111-115(1984)·Zbl 0551.62079号
[8] Esty,W.W.,《人口中班级数量和样本覆盖率的估计》,《数学科学家》,第10期,第41-50页(1985年)·Zbl 0585.62026号
[9] Esty,W.W.,《Good的非参数覆盖估计的效率》,《统计年鉴》,第14卷,第1257-1260页(1986年)·兹比尔0603.62051
[10] Harris,J.A.,《土壤微生物群落的测量以评估恢复的成功》,《欧洲土壤科学杂志》,54,801-808(2003)
[11] Lee,J.,1989年。关于发现新物种概率的NPMLE的渐近性和两阶段搜索中的自适应停止规则。未发表的博士论文。威斯康星大学麦迪逊分校统计系。;Lee,J.,1989年。关于发现新物种概率的NPMLE的渐近性和两阶段搜索中的自适应停止规则。未发表的博士论文。威斯康星大学麦迪逊分校统计系。
[12] 三好,T。;岩崎,T。;Naganuma,T.,通过0.2微米孔径过滤器的深水微生物16S rRNA基因克隆的系统发育特征,应用与环境微生物学,71,2,1084-1088(2005)
[13] Nayak,T.K.,关于通过重新捕获抽样估计系统中错误数的注释,《统计学与概率快报》,7191-194(1989)·Zbl 0665.62105号
[14] Okello,J.B.A。;Wittemyer,G。;拉斯穆森,H.B。;道格拉斯·哈密尔顿,I。;Nyakaana,S。;Arctander,P。;Siegismund,H.R.,非洲草原象微卫星的非侵入性基因分型和孟德尔分析,遗传杂志,96,6,679-687(2005)
[15] 拉斯穆森,S.L。;Starr,N.,《新物种搜索中的最优和自适应停止》,美国统计协会杂志,74661-667(1979)·Zbl 0421.62066号
[16] Schloss,P.D。;Handelsman,J.,《宏基因组学的统计工具箱:评估微生物群落的功能多样性》,BMC生物信息学,9,34(2008)
[17] Smith,W。;A.R.索洛。;Preston,P.E.,使用修正的贝塔二项模型估算物种重叠,生物统计学,52,1472-1477(1996)·Zbl 0875.62557号
[18] 站立,D。;Baggs,E.M。;Wattenbach,M。;史密斯,P。;Killham,K.,《土壤生物学和肥力,应对植物-土壤-微生物系统中放大过程的挑战》,44,245-257(2007)
[19] Starr,N.,发现新物种概率的线性估计,《统计年鉴》,7644-652(1979)·Zbl 0405.62025号
[20] Yue,J.C。;克莱顿,M.K。;Lin,F.,物种重叠的非参数估计,生物统计学,57,743-749(2001)·兹比尔1209.62370
[21] Yue,J.C。;Clayton,M.K.,《基于物种比例的重叠度量》,《统计学中的通信——理论和方法》,342123-2131(2005)·Zbl 1074.62072号
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。