×
陈博森;李成伟

关于基因调控网络的熵和稳健性之间的相互作用。 （英语） Zbl 1229.92037号

熵 12，第5期，1071-1101（2010）.
摘要：基因网络的熵和鲁棒性之间的相互作用是系统生物学的核心机制。熵是由于基因调控网络中的随机参数波动和环境噪声导致的物理系统的随机性或无序性的度量。基因调控网络的鲁棒性可以用容忍随机参数波动和衰减环境噪声影响的能力来衡量，将从鲁棒H_（{）稳定和滤波的角度来讨论。在这篇综述中，我们还将讨论它们在进化中的平衡作用以及在系统和合成生物学中的潜在应用。

引用于三文件

MSC公司：

92立方厘米 系统生物学、网络
94甲17 信息的度量，熵

关键词：

熵鲁棒性;动力学参数波动;随机噪声;基因网络的进化;合成基因网络;系统与合成生物学;鲁棒稳定与滤波

软件：

地雷
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{B.-S.Chen}和\textit{C.-W.Li}，熵12，No.5，1071--1101（2010；Zbl 1229.92037）
全文： 内政部

参考文献：

[1] 内政部：10.1038/ng869·doi:10.1038/ng869
[2] 内政部：10.1073/pnas.151588598·doi:10.1073/美国国家统计局.151588598
[3] 内政部：10.1016/S0006-3495（02）75635-X·doi:10.1016/S0006-3495（02）75635-X
[4] DOI:10.1126/科学.1109090·doi:10.1126/science.1109090
[5] DOI:10.1073/pnas.0509874103·doi:10.1073/pnas.0509874103
[6] DOI:10.1126/科学.1146747·doi:10.1126/science.1146747
[7] DOI:10.1016/j.molcel.2009.11.018·doi:10.1016/j.molcel.2009.11.018
[8] 内政部：10.1016/j.jmb.2003.09.049·doi:10.1016/j.jmb.2003.09.049
[9] DOI:10.1016/S0168-9525（98）01659-X·doi:10.1016/S0168-9525（98）01659-X
[10] 内政部：10.1186/1752-0509-3-48·doi:10.1186/1752-0509-3-48
[11] DOI:10.1098/rsif.2006.0140·doi:10.1098/rsif.2006.0140
[12] Ji，连续隐马尔可夫模型的变分贝叶斯及其在主动学习中的应用，IEEE Trans。图案。分析。马赫。智力。第28页，522页–（2006年）·Zbl 05111114号 ·doi:10.1109/TPAMI.2006.85
[13] 王，最大熵原理与种群遗传平衡，学报。遗传学。罪恶。第29页562页–（2002年）
[14] 内政部：10.1006/jtbi.2000.2106·doi:10.1006/jtbi.2000.2106
[15] DOI:10.1103/PhysRevLett.98.158701·doi:10.10103/PhysRevLett.98158701
[16] DOI:10.1103/PhysRevE.68.021904·doi:10.1103/PhysRevE.68.021904
[17] DOI:10.1103/Phys修订版E.76.036115·doi:10.1103/PhysRevE.76.036115
[18] 内政部：10.1186/1471-2105-8-20·doi:10.1186/1471-2105-8-20
[19] DOI:10.1073/pnas.0609152103·doi:10.1073/pnas.0609152103
[20] 内政部：10.1103/PhysRevE.76.011917·doi:10.1103/PhysRevE.76.011917
[21] DOI:10.1103/PhysRevE.76.051915·doi:10.1103/PhysRevE.76.051915
[22] 内政部：10.1186/1752-0509-2-106·数字对象标识代码：10.1186/1752-0509-2-106
[23] DOI:10.1152/ajpregu.00407.2001·doi:10.1152/ajpregu.00407.2001
[24] DOI:10.1016/S0006-3495（03）70013-7·doi:10.1016/S0006-3495（03）70013-7
[25] DOI:10.1016/j.ymben.2006.01.007·doi:10.1016/j.ymben.2006.01.007
[26] DOI:10.1093/生物信息学/btl364·doi:10.1093/bioinformatics/btl364
[27] 内政部：10.1186/1471-2105-7-52·doi:10.1186/1471-2105-7-52
[28] 内政部：10.1007/s00285-005-0360-4·Zbl 1086.92001号 ·doi:10.1007/s00285-005-0360-4
[29] 内政部：10.1186/1471-2105-8-S2-S5·doi:10.186/1471-2105-8-S2-S5
[30] 内政部：10.1186/1471-2105-9-461·doi:10.1186/1471-2105-9-461
[31] 内政部：10.1093/bioinformatics/bti348·doi:10.1093/bioinformatics/bti348
[32] 内政部：10.1016/j.ms.2007.11.002·Zbl 1130.92023号 ·doi:10.1016/j.mbs.2007.11.002
[33] DOI:10.1371/journal.pcbi.0030103·doi:10.1371/journal.pcbi.0030103
[34] 内政部：10.1142/S0218127405012636·Zbl 1073.92028号 ·doi:10.1142/S0218127405012636
[35] 内政部：10.1109/TSMCB.2007.906975·doi:10.1109/TSMCB.2007.906975
[36] 内政部：10.1038/nrg1471·doi:10.1038/nrg1471
[37] DOI:10.1073/pnas.0800579105·doi:10.1073/pnas.0800579105
[38] 内政部：10.1021/bp0000712·数字对象标识代码：10.1021/bp0000712
[39] DOI:10.1016/j.cub.2006.09.013·doi:10.1016/j.cub.2006.09.013
[40] 内政部：10.1186/1752-0509-2-103·doi:10.1186/1752-0509-2-103
[41] 内政部：10.1109/TBCAS.2008.926728·doi:10.1109/TBCAS.2008.926728
[42] DOI:10.1016/j.mbs.2009.09.004·Zbl 1178.92023号 ·doi:10.1016/j.mbs.2009.09.004
[43] DOI:10.1049/iet-syb2008.0121·doi:10.1049/iet-syb2008.0121
[44] 内政部：10.1038/nature01257·doi:10.1038/nature01257
[45] DOI:10.1073/pnas.0708708105·doi:10.1073/pnas.0708708105
[46] 内政部：10.1038/35002125·doi:10.1038/35002125
[47] 内政部：10.1093/bioinformatics/btm362·doi:10.1093/bioinformatics/btm362
[48] DOI:10.1093/生物信息学/btp310·Zbl 05744099号 ·doi:10.1093/bioinformatics/btp310
[49] 内政部：10.1186/1752-0509-3-66·doi:10.1186/1752-0509-3-66
[50] 内政部：10.1038/nrg1615·数字对象标识代码：10.1038/nrg1615
[51] Li，果蝇早期发育中基因/蛋白质相互作用网络的随机时空动力学模型，基因调控。系统。生物3第191页–（2009年）
[52] 陈，网络进化中自然选择的基本原则：系统生物学方法，进化。生物信息。第3页245页–（2007年）
[53] Chen，《生物化学网络在进化中的适应性设计规则》，Evol。生物信息。第27页，第3页–（2007年）
[54] 内政部：10.1109/91.797980·doi:10.1109/91.797980
[55] 内政部：10.1109/91.855915·doi:10.1109/91.855915
[56] 内政部：10.1109/TAC.2003.821400·Zbl 1365.93539号 ·doi:10.1109/TAC.2003.821400
[57] 内政部：10.1137/S0363012903423727·Zbl 1157.93019号 ·doi:10.1137/S0363012903423727
[58] 内政部：10.1109/TSP.2004.840724·Zbl 1370.93293号 ·doi:10.1109/TSP.2004.840724
[59] DOI:10.1038/nature01546·doi:10.1038/nature01546
[60] 数字对象标识码：10.1073/pnas.94.3.814·doi:10.1073/pnas.94.3.814
[61] Voit，《生物化学系统的计算分析：生物化学家和分子生物学家实用指南》，pp xii–（2000）
[62] Boyd，系统和控制理论中的线性矩阵不等式pp ix–（1994）
[63] Li，关于随机Hodgkin-Huxley神经元系统的噪声增强能力，神经计算（2010）·Zbl 1192.92006年
[64] Savageau，《生化系统分析：分子生物学中的功能和设计研究》，pp xvii–（1976）·兹伯利2013年9月9日
[65] 内政部：10.1109/TBCAS.2007.907060·doi:10.1109/TBCAS.2007.907060
[66] 弗里曼，进化分析第xiv页–（2004）
[67] 林奇，遗传学和数量性状分析pp-xvi–（1998）
[68] DOI:10.1073/pnas.1332628100·doi:10.1073/pnas.1332628100
[69] 内政部：10.1038/ng1340·doi:10.1038/ng1340
[70] DOI:10.1038/35042500·doi:10.1038/35042500
[71] 内政部：10.1038/msb4100073·doi:10.1038/msb4100073
[72] 内政部：10.1038/nature04342·doi:10.1038/nature04342
[73] 内政部：10.1109/TFUZZ.2010.2070842·doi:10.1109/TFUZZ.2010.2070842
[74] 陈，基于遗传算法的具有指定振幅、周期和相位的鲁棒合成遗传振荡器的设计算法，基因注册系统。生物学（2010）
[75] 内政部：10.1007/BF02607055·Zbl 1110.62051号 ·doi:10.1007/BF02607055
[76] 内政部：10.1007/s102080010030·Zbl 1057.68085号 ·doi:10.1007/s102080010030
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。