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不确定代谢网络稳定性分析的保证和随机方法。 (英语) Zbl 1402.92221号

Lévine,Jean(ed.)等人,控制、信号和物理建模系统理论的进展。论文基于2009年1月至6月在瑞士洛桑伯努利计划上的陈述。柏林:施普林格出版社(ISBN 978-3-642-16134-6/pbk;978-3-442-16135-3/电子书)。控制与信息科学课堂讲稿407,297-307(2011)。
摘要:阻碍我们理解大规模代谢网络动力学的一个持续存在的问题是缺乏建立生物化学过程计算模型所必需的实验确定的动力学参数。为了克服缺少或不完整动力学数据带来的一些限制,结构动力学建模(SKM)最近被提出,作为化学计量分析和完整动力学描述之间的一种中间方法。SKM利用雅可比矩阵的适当参数化,通过局部稳定性分析扩展了稳态通量平衡分析(FBA)。为了表征雅可比,我们利用鲁棒控制理论的结果来确定雅可比项对应于渐近稳定代谢状态的子区间。此外,我们提出了一种有效的采样方案,并结合计算几何中的方法来绘制稳定区域。糖酵解途径模型包含12个不确定参数,用于评估该方法的可行性。
关于整个系列,请参见[兹比尔1203.93006].

MSC公司:

92C45型 生化问题中的动力学(药代动力学、酶动力学等)
第92页第42页 系统生物学、网络
93D09型 鲁棒稳定性
93立方厘米 信息不完整的控制/观测系统
93二氧化碳 控制理论中的线性系统

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