Yang,Jae-Suk先生;夸克,伍索普 使用SMMP将Wang-Landau采样应用于蛋白质模型。 (英语) Zbl 1205.82034号 计算。物理学。Commun公司。 181,第1期,99-104(2010). 小结:我们使用蛋白质简单分子力学(SMMP)将Wang-Landau采样应用于蛋白质的连续能量模型。我们还尝试将王兰道抽样方法进行并行化,并将我们的结果与以前从多标准和并行回火方法获得的结果进行比较。 MSC公司: 82-08 计算方法(统计力学)(MSC2010) 82D60型 聚合物统计力学 82B80型 平衡统计力学中的数值方法(MSC2010) 65二氧化碳 蒙特卡罗方法 关键词:王兰道采样;并行化;连续能量模型;蛋白质折叠 软件:SMMP公司 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{J.-S.Yang}和\textit{W.Kwak},计算。物理学。Commun公司。181,编号1,99--104(2010;Zbl 1205.82034) 全文: DOI程序 参考文献: [1] W.夸克。;Yang,J.-S。;Sohn,J.等人。;Kim,I.-m.,Phys。版本E,75,061110(2007) [2] W.夸克。;Yang,J.-S。;Kim,I.-m。;Landau,D.P.,物理学。版本E,75,041108(2007) [3] Yang,J.-S。;Kim,I.-m。;Kwak,W.,J.韩国物理学。Soc.,52,1947(2008) [4] Yang,J.-S。;Kim,I.-m。;Kwak,W.和Phys。修订版E,77051122(2008) [5] 费伦伯格,A.M。;Landau,D.P.,物理学。B版,44,5081(1991) [6] 费伦伯格,A.M。;Landau,D.P。;Swendson,R.H.,物理学。E版,51,5092(1995) [7] W.夸克。;Yang,J.-S。;Sohn,J。;Kim,I.-m.,Phys。版本E,75,061130(2007) [8] E.马里纳里。;Parisi,G.和Europhys。莱特。,19, 451 (1992) [9] Hansmann,U.H.E,化学。物理学。莱特。,281, 140 (1997) [10] Hansmann,联合王国。;Okamoto,Y.,J.计算。化学。,18, 920 (1997) [11] W.夸克。;Hansmann,U.H.E.,物理学。修订稿。,95, 138102 (2005) [12] 阿列克申科,V。;W.夸克。;Hansmann,U.H.E.,《物理A》,350,28(2005) [13] Wang,F。;Landau,D.P.,物理学。修订稿。,86, 2050 (2001) [14] Landau,D.P。;蔡,S.-H。;埃克斯勒,M.,Am.J.Phys。,72, 1294 (2004) [15] B.J.舒尔茨。;粘合剂,K。;米勒,M。;Landau,D.P.,物理学。E版,67,067102(2003) [16] Scott Shell,M。;Debenedetti,P.G。;Panagiotopoulos,A.Z.,物理学。E版,66,056703(2002) [17] 周,C。;Schulthess,T.C。;托布吕格,S。;Landau,D.P.,物理学。修订稿。,96, 120201 (2006) [18] 山口,C。;Okabe,Y.,J.Phys。A: 数学。Gen.,34,8781(2001)·Zbl 0994.82042号 [19] 周,C。;巴特,R.N.,物理学。E版,72,025701(2005) [20] Berg,B.A.,《国际法学杂志》。物理学。C、 4249(1993) [21] Berg,B.A。;Neuhaus,T.,物理学。修订稿。,68,9(1992年) [22] 北拉托尔。;de Pablo,J.J.和J.化学。物理。,116, 7225 (2002) [23] 北拉托尔。;诺茨,T.A。;de Pablo,J.J.和J.化学。物理。,118, 4285 (2003) [24] Wüst,T。;Landau,D.P.,计算。物理学。通信,179124(2008)·Zbl 1197.82031号 [25] Eisenmenger,F。;Hansmann,联合王国。;Sh.Hayryan。;Hu,C.K.,计算。物理学。Comm.,138192(2001)·Zbl 0980.92011号 [26] Eisenmenger,F。;Hansmann,联合王国。;Hayryan,S。;胡春光,《计算机》。物理学。Comm.,174422(2006)·Zbl 1196.82046号 [27] de Oliveira,P.M.C。;佩纳,T.J.P。;Herrman,H.J.,巴西物理学杂志。,26, 677 (1996) [28] Wang,J.-S.,《物理A》,281147(2000) 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。