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Johannes H.G.M.Van Beek著。;安妮·克里斯汀·豪希尔德;汉内斯·海特林;托马斯·宾斯。

人体和动物代谢系统的稳健建模、测量和分析。 （英语） Zbl 1185.93013号

菲洛斯。变速器。英国皇家学会。，序列号。A、 数学。物理学。工程科学。 367，第1895号，1971-1992（2009）.
小结：缺乏准确的定量参数和大量的生化反应阻碍了对人类和动物代谢的建模。这个问题可以通过以下方式解决：（i）独立研究网络的模块；（ii）集合模拟，以探索许多合理的参数组合；（iii）分析“草率”参数行为，揭示相互依赖的参数组合，影响很小；（iv）结合分子和整个网络数据的多尺度分析；（v）通过稳定同位素标记测量体内代谢通量（流速）。对于后一种方法，碳转移网络是用常微分方程系统建模的，但我们表明彩色Petri网提供了一种更直观的图形方法。参数敏感性分析表明，只有少数参数组合对预测有较大影响。高能磷酸盐转运的模型分析表明，在细胞器水平上尚不准确的膜通透性，可以从整体反应中很好地确定。考虑到测量分子参数的不精确性的集合模拟与流行的假设相矛盾，即心肌中的高能磷酸盐运输主要是通过磷酸肌酸进行的。将模块化、多尺度、集成和松散建模方法与活体流量测量相结合，对于大型人类代谢系统的建模可能是不可或缺的。

MSC公司：

93A30型 系统数学建模（MSC2010）
92 C50 医疗应用（通用）

关键词：

系统生物学;代谢途径;代谢通量;代谢网络;三羧酸循环;Petri网

软件：

R（右）;牢房设计师;生物模型;Sloppy单元格
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{J.H.G.M.Van Beek}等人，Philos。变速器。英国皇家学会。，序列号。A、 数学。物理学。工程科学。367，第1895号，1971--1992（2009；Zbl 1185.93013）
全文： 内政部

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