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丹尼尔·卡坦扎罗

最小进化问题：概述和分类。 （英语） 兹比尔1168.92036

网络 53，第2期，112-125（2009）.
摘要：分子系统发育学通过分子数据研究生物体之间的等级进化关系。这些关系通常通过加权树或系统发育来描述，其叶子代表观察到的有机体、中间祖先的内部顶点以及成对有机体之间进化关系的边缘。分子系统发育学提供了从可能的备选方案中选择一个系统发育的几个标准。通常，这些标准可以用目标函数表示，优化它们的系统发育被称为最优。
其中一个最重要的标准是最小进化（ME）标准，该标准规定，给定一组生物的最佳系统发育是边缘权重之和最小的系统发育。找到满足ME标准的系统发育涉及解决一个优化问题，称为最小进化问题（MEP），这是众所周知的困难。本文概述了MEP，并讨论了文献中出现的MEP的不同版本。

引用于13文件

MSC公司：

92D15型 与进化有关的问题
92C40型 生物化学、分子生物学
05二氧化碳 树
05C90年 图论的应用
65K10码 数值优化和变分技术
90 C90 数学规划的应用

关键词：

网络设计；计算生物学；系统发育估计；最小进化；常最小二乘方；加权最小二乘法

软件：

生物技术研究所；fastDNAml（快速DNAml）；梅特里；PAUP公司*
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{D.Catanzaro}，Networks 53，No.2，112--125（2009；Zbl 1168.92036）
全文： DOI程序

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