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遗传调控网络的计算树规则逻辑。 (英语) Zbl 1183.68380号

Cha,Sungdeok(Steve)(编辑)等人,《验证和分析自动化技术》。2008年10月20日至23日,第六届国际研讨会,ATVA 2008,韩国首尔。诉讼程序。柏林:施普林格出版社(ISBN 978-3-540-88386-9/pbk)。计算机科学课堂讲稿5311,48-63(2008)。
摘要:模型检查已被证明是一种有用的分析技术,不仅适用于并发系统,也适用于遗传调控网络(Grn公司s) 控制活细胞的功能。模型检查在系统生物学中的应用表明,时序逻辑应该能够捕获分支时间和公平性属性。同时,它们应该具有易于非专业人员使用的用户友好语法。在本文中,我们定义Ctrl键(计算树规则逻辑),是控制使用正则表达式和公平操作符来尝试匹配这些标准。Ctrl键包含两者Ctl公司,具有一组由正则表达式索引的简化时态运算符,灵感来自Pdl公司(命题动态逻辑)。我们还开发了Ctrl键进入之内嗯,R(Hennessy-Milner逻辑与递归),模态\(\mu\)演算的一个等式变体。这使我们能够获得一个具有以下诊断功能的飞行模型检查器Ctrl键通过直接重用卡德普工具箱。我们举例说明了Ctrl键通过分析模型检查器Grn公司控制大肠杆菌的碳饥饿反应。
关于整个系列,请参见[Zbl 1148.68001号].

MSC公司:

第68季度第60季度 规范和验证(程序逻辑、模型检查等)
03B44号 时间逻辑
03B45号 模态逻辑(包括规范逻辑)
92立方厘米 系统生物学、网络
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