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结构生物信息学。算法方法。 (英语) Zbl 1259.92029号

查普曼和霍尔/CRC数学和计算生物学系列佛罗里达州博卡拉顿:CRC出版社(ISBN 978-1-58488-683-9/hbk)。第二十三、406页。(2009).
出版商描述:本书为一学期的本科课程提供了框架,展示了如何应用关键算法来解决与大分子结构相关的问题。它有助于学生进一步学习结构生物学。
根据前几章中的一些介绍性材料,本文使用动态规划解决最长的常见子序列问题,并解释Nussinov和MFOLD算法的科学模型。然后回顾序列比对,以及测量大分子几何性质所需的基本数学计算。在研究坐标变换如何促进三维空间中分子的平移和旋转之后,作者介绍了结构比较技术、叠加算法以及比较蛋白质内部关系的算法。最后一章探讨了回归和分类如何在蛋白质分析和药物设计中变得更加有用。
结合生物学、数学和计算机科学,本实用文本介绍了科学方法中的各种生物信息学主题和问题,该方法强调自然(经验观察的来源)、科学(自然过程的数学建模)、,和计算(基于数学模型计算预测和数学对象的科学)。

MSC公司:

92立方厘米 系统生物学、网络
92C40型 生物化学、分子生物学
90立方厘米 动态编程
92-01 与生物学有关的介绍性阐述(教科书、辅导论文等)
90 C90 数学规划的应用
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