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普雷塔姆·戈什；萨米克·戈什；Kalyan巴苏；Das，Sajal K。

基于随机事件模拟的快速计算参数模型，用于估计蛋白质和对接时间。 （英语） Zbl 1141.92314号

Priami，Corrado（编辑），《计算系统生物学学报》VIII。柏林：施普林格出版社（ISBN 978-3-540-76638-4/pbk）。计算机科学课堂讲稿4780。生物信息学课堂讲稿。《期刊分栏》，14-41（2007）。
小结：本文提出了一个计算快速的分析模型，用于估计生物途径中蛋白质-配体对接所需的时间。据报道，细胞内的环境不稳定，具有相当程度的随机性，从而产生随机共振。为了便于理解生物系统的动态行为，我们提出了一种基于“电子”随机事件的模拟。该模拟的实现需要计算不同生物事件的执行时间，例如作为随机变量的蛋白质-配体对接过程（配体-蛋白质结合所需的时间）。系统的下一个事件时间是通过将事件执行时间与事件开始时间的时钟值相加来计算的。我们的数学模型特别考虑了配体与蛋白质对接的实际生物过程，强调了配体、蛋白质的结构配置和结合机制，使我们能够大大控制模型参数。我们使用一种基于碰撞理论的改进方法来捕获此问题在离散时间内的随机性，并估计此过程的前两个时刻。第一时刻的数值结果显示出与实验结果的良好一致性，并证明了我们模型的有效性。
关于整个系列，请参见[Zbl 1137.92300号].

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92C40型 生物化学、分子生物学
92-08 生物问题的计算方法

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\textit{P.Ghosh}等人，Lect。注释计算。科学。4780，14-41（2007；Zbl 1141.92314）
全文： 内政部

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