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使用标准混合模型软件对双胞胎和家庭数据进行生物测量建模。 (英语) Zbl 1132.62094号

摘要:双胞胎或其他家族数据的生物遗传学建模可用于将观察到的反应或“表型”的方差分解为遗传和环境成分。提出了一种方便的参数化方法,它需要很少的随机效应,这使得可以使用广泛可用的线性混合模型(连续表型)或广义线性混合模型的软件来估计此类模型。我们通过对连续表型出生体重的家庭数据和二分法表型抑郁症的双胞胎数据进行建模来说明所提出的方法。Stata和R/S-PLUS的示例数据集和命令可在Biometrics网站上找到。

MSC公司:

62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
92D10型 遗传学和表观遗传学
62J12型 广义线性模型(逻辑模型)
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全文: 内政部 链接

参考文献:

[1] Breslow,第二届西雅图生物统计学研讨会论文集:相关数据分析第1页–(2005)
[2] Breslow,广义线性混合模型中的近似推断,《美国统计协会杂志》88第9页–(1993)·Zbl 0775.62195号 ·doi:10.2307/2290687
[3] Browne,MLwiN 2.0版中的MCMC估计。(2005)
[4] 伯顿,使用广义线性混合模型(GLMMs)和吉布斯抽样对二元表型进行遗传方差成分分析,《遗传流行病学》17第118页–(1999)·doi:10.1002/(SICI)1098-2272(1999)17:2<118::AID-GEPI3>3.0.CO;2伏
[5] Dominicus,《行为遗传学中的似然比测试:问题与解决方案》,《行为遗传》36页331–(2005)·doi:10.1007/s10519-005-9034-7
[6] Elston,引言和概述,《医学研究中的统计方法》9,第527页–(2001年)·Zbl 1121.62600号 ·doi:10.1191/096228000666851885
[7] Falconer,《数量遗传学导论》(1996年)
[8] 费舍尔,孟德尔遗传假设下亲属之间的相关性,《爱丁堡皇家学会学报》52页399–(1918)·网址:10.1017/S0080456800012163
[9] 郭,行为遗传分析的混合或多水平模型,《行为遗传学》32页37–(2002)·doi:10.1023/A:1014455812027
[10] Hedeker,MIXOR:用于混合效应序数概率和逻辑回归分析的计算机程序,《生物医学中的计算机方法和程序》49,第157页–(1996)·doi:10.1016/0169-2607(96)01720-8
[11] Jinks,《生物特征遗传学、MAVA和人类行为分析经典方法的比较》,《心理学公报》73第311页–(1970)·doi:10.1037/h0029135
[12] 库里,《遗传流行病学基础》(1993年)
[13] 利拉德,aML用户指南和参考手册(2000年)
[14] 马格努斯,父亲对出生体重的贡献,《流行病学与社区卫生杂志》第55页第873页-(2001)·doi:10.1136/jech.55.12.873
[15] McArdle,《生物特征家族分析的混合效应方差分量模型》,《行为遗传学》35,第631页–(2005年)·doi:10.1007/s10519-005-2868-1
[16] Neale,M.C.Maes,H.H.2004双胞胎和家庭遗传研究方法http://ibgwww.colorado.edu/workshop2004/cdrom/HTML/book2004a.pdf
[17] Neale,M.C.Boker,S.M.Xie,G.Maes,H.H.2004 Mx:统计建模(第六版)http://www.vipbg.vcu.edu/mxgui/
[18] Pawitan,使用家庭数据估算二元性状的遗传和环境因素,《医学统计》23,第449页–(2004)·数字对象标识代码:10.1002/sim.1603
[19] Rabe-Hesketh,分类数据的多元随机效应模型参数化,《生物计量学》57页1256–(2001)·Zbl 1209.62136号 ·doi:10.1111/j.0006-341X.20011.256_1.x
[20] Rabe-Hesketh,S.Skrondal,A.2005使用Stata Stata Press进行多级和纵向建模
[21] Rabe-Hesketh,《纵向数据分析:现代统计方法手册》(2007年)·Zbl 1277.62001
[22] Rabe-Hesketh,具有嵌套随机效应的有限和离散因变量模型的最大似然估计,《计量经济学杂志》128页301–(2005)·兹比尔1336.62079 ·doi:10.1016/j.jeconom.2004.08.017
[23] 罗德里格斯(Rodriguez),《带二进制响应的多水平模型估计程序评估》,《皇家统计学会杂志》,A辑158,第73页–(1995)·Zbl 04523393号 ·doi:10.2307/2983404
[24] 罗德里格斯,《改进的二元响应多水平模型估计程序:案例研究》,《皇家统计学会杂志》,A辑164页339–(2001)·Zbl 1002.62507号 ·doi:10.1111/1467-985X.00206
[25] Skrondal,A.Rabe-Hesketh,S.2004广义潜在变量建模:多级、纵向和结构方程模型·Zbl 1097.62001
[26] Spiegelhalter,BUGS 0.5 Bayesian分析,使用Gibbs采样。手册(第二版)(1996年)
[27] van den Oord,在多水平模型中估计潜在和测量基因型的影响,《医学研究中的统计方法》10,第393页–(2001)·Zbl 1121.62684号 ·doi:10.1191/096228001682157625
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