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阿尔芒多·埃尔南德斯·蒙多萨;卡门·奎托;洛伦佐·塞戈维亚;埃内斯托·佩雷兹·鲁埃达

耐药调节细胞分裂（RND）蛋白中的配体结合预测。 （英语） 2011年11月14日Zbl

计算。生物化学。 31，第2期，115-123（2007）.
摘要：耐药调节细胞分裂（RND）蛋白家族是一类普遍存在于细菌中的蛋白质。这些蛋白质参与多种药物在细菌细胞膜上的转运，具有广泛的底物特异性，起着外排泵的作用。在这项工作中，一个属于RND蛋白家族的蛋白质，大肠杆菌的AcrB，被用作一个工作模型，在电子版中预测47个RND蛋白运输的化合物。我们从AcrB中提取并聚集了14个直接参与底物相互作用的氨基酸。这种聚类提供了足够的信息来识别16个与其挤出的配体相关的基团，例如排出芳香烃的蛋白质（SrpB簇）或排出重金属的蛋白质（CnrA簇）。保守、簇特异性和可变残基之间的关系表明，尽管配体结合结构域在结构上是保守的，但它有足够的灵活性来特异性地识别分子的多样性。

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学

关键词：

RND蛋白;AcrB公司;配体结合预测

软件：

ClustalW公司;ConSeq公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{A.Hernandez-Mendoza}等人，计算。生物化学。31，编号2115-123（2007年；兹bl 1124.92011）
全文： DOI程序

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