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张世华;宁雪梅;张向孙

通过团渗流聚类识别PPI网络中的功能模块。 （英语） Zbl 1112.92028号

计算。生物化学。 30，第6期，445-451（2006）.
摘要：大规模实验和数据集成为系统分析和全面理解细胞内生物网络和生化过程的拓扑结构提供了机会。模块化结构包含基本生物功能单元中涉及的基因/蛋白质组，是相互作用蛋白质的基本组织形式。
我们应用基于团逾渗聚类的图聚类算法来检测蛋白质相互作用（PPI）网络的重叠网络模块。我们对酿酒酵母的分析表明，大多数检测到的模块对应于一个或多个实验功能模块，其中一半注释模块与实验确定的蛋白质复合物匹配良好。我们的分析方法当然可以应用于任何物种甚至其他生物网络的蛋白质相互作用数据。

引用于2文件

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学
92-08 生物学问题的计算方法

关键词：

蛋白质相互作用（PPI）网络;网络群集;蛋白质复合物

软件：

生物布局;m代码;C索引器
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{S.Zhang}等人，计算。生物化学。30，第6号，445--451（2006；Zbl 1112.92028）
全文： DOI程序

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