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K.萨拉博吉。;米歇尔·格罗米哈;彭努斯瓦米，M.N。

二级结构和溶剂可及性对蛋白质突变体稳定性的相对重要性。T4和人类溶菌酶的氨基酸特性和能量学案例研究。 （英语） 兹比尔1095.92037

计算。生物化学。 29，第1期，25-35（2005）.
摘要：了解影响蛋白质突变体稳定性的因素是分子和计算生物学中的一项重要任务。我们通过研究突变体残基的二级结构和溶剂可及性对于理解/预测蛋白质突变体的稳定性的相对重要性来解决这个问题。在本研究中，我们使用了疏水、静电和氢键自由能项以及氨基酸的九种独特的物理化学、能量和构象性质，这些参数与热稳定性的变化有关\)基于单相关系数和多重相关系数的所有溶菌酶单突变体。正如预期的那样，反映疏水性和疏水自由能的特性在区分稳定突变体和不稳定突变体方面起着重要作用。碳和氮原子产生的疏水自由能区分线圈和链突变的稳定性，准确度分别为100%和90%。
与之前的结果一致，基于二级结构的子群分类及其在结构中的位置信息与实验值（Delta T_m）有良好的关系。我们发现二级结构信息对于理解蛋白质突变体的稳定性与溶剂可及性同等或更重要。氨基酸性质与自由能项的比较表明，能量贡献更好地解释了卷曲区的突变稳定性，而链区的氨基酸性质更好。此外，自由能与氨基酸性质的结合显著增加了相关性。本研究证明了基于二级结构对突变后蛋白质稳定性进行分类的重要性。

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MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学

关键词：

蛋白质稳定性;氨基酸特性;自由能;蛋白质突变体;多元回归分析

软件：

不可访问;ProTherm公司
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\textit{K.Saraboji}等人，计算。生物化学。29，第1号，25-35（2005；Zbl 1095.92037）
全文： 内政部

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