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李爱琴；Dowell，Earl H。

生物分子数学模型的模态简化。 （英语） Zbl 1073.92008年

J.计算。物理学。 211，第1期，262-288（2006）.
摘要：本文报道了在谐波激励下，基于线性简正模（LNM）分析或适当正交分解（POD）对单个（α）-（D）-吡喃葡萄糖单体以及附着在移动原子力显微镜（AFM）上的单体链进行建模的模态降阶的详细研究。提出了一种结合POD和部件模态综合的模态降阶方法。报告了这些方法的准确性和效率。
本研究的重点是确定这些方法在多大程度上可以减少分子建模的时间和成本，同时提供所需的准确性。研究表明，线性降阶模型适用于小振幅激励和低频激励。研究发现，基于POD模式的非线性降阶模型即使对于大激励也能提供良好的近似，而使用线性本征模作为基向量的非线性降阶模型对于建模具有强非线性的分子的效果较差。基于组件模态综合的降阶模型使用每个组件的POD模式也给出了很好的近似值。使用这些方法可以减少系统的维数，从而显著减少计算时间和成本。

引用于2文件

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学
92C05型 生物物理学

关键词：

模态简化；生物分子；线性正常模式；本征正交分解；部件模态分析

软件：

名称2；查姆
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{A.Li}和\textit{E.H.Dowell}，J.Compute。物理学。211，第1号，262--288（2006；Zbl 1073.92008）
全文： 内政部

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