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基于微阵列临床研究的早期诊断标记小组测定。 (英语) Zbl 1077.92033号

摘要:我们提出了一种新的、经济高效的预测性临床基因表达研究的两阶段设计:早期标记小组测定(EMPD)。在第一阶段,全基因组微阵列仅用于少数个体患者样本。根据第一阶段的数据,衍生出一组标记基因。在第二阶段中,对大量患者测量这些标记面板基因的表达值,并从该数据中学习预测分类模型。第二阶段不需要使用昂贵的全基因组微阵列,因此EMPD是当前试验的一种经济高效的替代方案。将EMPD的预期性能损失与对所有患者使用全基因组微阵列的设计进行比较。我们还研究了1期患者数量与2期所需标记基因数量之间的权衡。通过对五个已发表的数据集的分析,我们发现在第一阶段,每组16名患者就足以确定一个由10个基因组成的合适的标记物组,而这一早期决定对最终性能的影响微乎其微。

MSC公司:

92 C50 医疗应用(通用)
62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析

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暮光
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