哦，Seyoung；Yun、Jae Heon；郑世英（Chung，Sei-Young） 蛋白质序列到结构映射的二次近似。 （英语） Zbl 1042.92010年 J.应用。数学。计算。 12，编号1-2，155-164（2003）. 摘要：提出了一种通过不定二次近似的序列-结构映射预测蛋白质给定残基对（C_α原子之间）之间距离的方法。预测技术需要在三维空间中用已知结构蛋白质残基的坐标拟合数据，并通过迭代最小化一个大的最小范数，得到20个氨基酸的数值表示。这些近似值用于给定残差对的距离预测。给出了布鲁克海文蛋白质数据库中一组小蛋白质测试集的一些计算经验。 MSC公司： 92C40型 生物化学、分子生物学 92-08 生物学问题的计算方法 46号30 泛函分析在概率论和统计学中的应用 92C05型 生物物理学 92D20型 蛋白质序列，DNA序列 关键词：序列到结构映射；二次近似 软件：SQOPT公司；QPOPT公司 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{S.Oh}等人，J.Appl。数学。计算。12，编号1--2，155-164（2003；Zbl 1042.92010） 全文： 内政部 参考文献： [1] 安芬森，C.B.，《蛋白质折叠原理》，《科学》，181，187-204（1973）·doi:10.1126/science.181.4096.223 [2] 伯恩斯坦，E.C。；Koetzle，T.F。；威廉姆斯，G.J.B。；Meyer，E。；医学博士布莱斯。；罗杰斯，J.R。；O.肯纳德。；Shikanouchi，T。；Tasumi，M.，蛋白质数据库：基于计算机的大分子结构档案文件，分子生物学杂志。，112, 535-542 (1977) ·doi:10.1016/S0022-2836（77）80200-3 [3] P.E.Gill、W.Murray和M.A.Saunders，《QPOPT 1.0用户指南：二次规划的fortran包》，《技术报告SOL 95-4》，斯坦福大学，1995年。 [4] P.E.Gill、W.Murray和M.A.Saunders，《SQOPT 5.3用户指南：大规模线性和二次规划的fortran包》，私人预印本，1997年。 [5] J.Holland，《自然和人工系统的适应》，密歇根大学出版社，1975年·Zbl 0317.68006号 [6] 柯克帕特里克，S。；盖拉特医学博士。；Vecchi，M.P.，《模拟退火优化》，《科学》，220219-227（1983）·Zbl 1225.90162号 ·doi:10.1212/科学220.4598.671 [7] Koretke，K.K。；Luthey-Schulten，Z。；Wolynes，P.G.，《通过分子动力学预测蛋白质结构的自洽优化能量函数》，Proc。国家。阿卡德。科学。美国，95，2932-2937（1998）·doi:10.1073/pnas.95.6.2932 [8] Moult，J。；佩德森，J。；Judson，R。；Fidelis，K.，《评估蛋白质结构预测方法的大规模实验》，《蛋白质：结构》。功能。Gen.，23，no3，ii-iv（1995）·doi:10.1002/port.340230303 [9] 斯坦普夫·D·R。；Felser，C.E。；Sussman，J.L.，PDBBrowse-Brookhacen蛋白质数据库的图形界面，《自然》，374572-574（1995）·数字对象标识代码：10.1038/374572a0 [10] Taylor，W.R.，蛋白质序列比较和结构预测中的模式匹配方法，Prot。工程师，277-86（1988）·doi:10.1093/蛋白质/2.2.77 [11] 昂格，R。；Moult，J.，《寻找蛋白质的最低自由能构象是一个NP-hard问题：证据与启示》，公牛。数学。《生物学》，55，1183-1198（1993）·Zbl 0791.92011号 [12] Walsh，L.L.，浏览布鲁克海文蛋白质数据库，Cabos Communication，10551-557（1994） 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。