路德维希·克里帕尔;佩德罗·巴拉奥纳 PSICO：用约束编程和优化求解蛋白质结构。 （英语） Zbl 1028.68026号 约束条件 7，编号3-4，317-331（2002）. 摘要：在本文中，我们提出了PSICO（Processing Structural Information with Constraint programming and Optimisation，用约束编程和优化处理结构信息）作为一种基于约束的方法，用于确定与从核磁共振（NMR）数据获得的距离约束兼容的蛋白质结构。我们将我们提出的算法与基于模拟退火的现有商业应用程序DYANA（“NMR应用程序的动态算法”）的性能进行了比较。在含有二聚体蛋白脱硫多辛实验数据的测试案例中，与DYANA大约10小时的计算时间相比，本文提出的方法在不到10分钟的时间内提供了类似的结果。虽然结果的质量仍然可以提高，但这表明CP技术可以大大减少计算时间，这是一个主要优点，因为结构核磁共振技术通常需要多次结构计算。 引用于4文件 MSC公司： 第68页第19页 其他编程范式（面向对象、顺序、并发、自动等） 关键词：约束编程;优化;蛋白质结构;生物信息学 软件：PSICO公司 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{L.Krippahl}和\textit{P.Barahona}，约束7，No.3--4317--331（2002；Zbl 1028.68026） 全文： 内政部