×

新算法和蛋白质物理。 (英语) Zbl 1017.92016年

摘要:我们回顾了现代模拟技术的最新发展,这些技术允许研究肽和小蛋白质的结构转换和折叠。作为这些技术应用的一个例子,我们研究了均聚物中螺旋的形成。然后将这些研究扩展到研究简单人工肽中螺旋-线圈跃迁和折叠之间的关系。最后,我们以36-残留绒毛膜头状肽HP-36为例,介绍了利用我们的技术预测蛋白质结构的最新结果。

MSC公司:

92C40型 生物化学、分子生物学

软件:

SMMP公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
全文: 内政部

参考文献:

[1] Hansmann,U.阁下。;冈本,Y.,Curr。操作。结构。《生物学》,9,177(1999)
[2] U.H.E.Hansmann,Y.Okamoto,in:D.Stauffer(Ed.),《计算物理年度评论》,第六卷,《世界科学》,新加坡,1999年,第129-157页。;U.H.E.Hansmann,Y.Okamoto,载于:D.Stauffer(编辑),《计算物理年度评论》,第六卷,《世界科学》,新加坡,1999年,第129-157页。
[3] Hansmann,联合王国。;Okamoto,Y.,J.计算。化学。,14333年(1993年)
[4] Berg,B.A.,《国际法学杂志》。物理学。C、 31083(1992)
[5] A.M.Ferrenberg、R.H.Swendsen和Phys。修订稿。63(1989)1658(E)。;A.M.Ferrenberg、R.H.Swendsen和Phys。修订稿。63(1989)1658(E)。
[6] 库马尔,S。;佩恩,P.W。;Vásquez,M.,J.计算。化学。,17, 1269 (1996)
[7] 冈本,Y。;Hansmann,U.H.E.,J.Phys。化学。,99, 2236 (1995)
[8] Alves,N.A。;Hansmann,U.H.E.,人工肽中螺旋的形成和折叠,J.Chem。物理。,117, 2337 (2002)
[9] 彭,Y。;Hansmann,U.H.E.,《生物物理学》。J.,82,3269(2002)
[10] Hansmann,联合王国。;Y.冈本,Phy。E版,56、2228(1997)
[11] E.M.F.库拉多。;Tsallis,C.,J.Phys。A: 数学。Gen.,27,3663(1994)
[12] Wenzel,W。;哈马彻,K.,Phys。修订稿。,82, 3003 (1999) ·Zbl 1031.81538号
[13] Hansmann,U.H.E.,《欧洲物理学》。J.B,12,607(1999)
[14] Hansmann,联合王国。;Wille,L.T.,《物理学》。修订稿。,88068105(2002年)
[15] Geyer,G.J.,《统计科学》。,7, 437 (1992)
[16] Hansmann,U.H.E.,化学。物理学。莱特。,281, 140 (1997)
[17] Y.Sugita。;Okamoto,Y.,化学。物理学。莱特。,314、141(2000年)
[18] 波兰,D。;Scheraga,H.A.,《生物聚合物螺旋-线圈转变理论》(1970),学术出版社:纽约学术出版社
[19] Alves,N.A。;Hansmann,U.H.E.,物理学。修订稿。,84, 1836 (2000)
[20] Eisenmenger,F。;Hansmann,联合王国。;Sh.Hayryan。;胡春光,《计算机》。物理学。社区。,138, 192 (2001) ·Zbl 0980.92011号
[21] Sippl,M.J。;Némethy,G。;Scheraga,H.A.和J.Phys。化学。,88、6231(1984)及其引用
[22] 铰链,B。;里奇·R·H。;费雷尔,T.L。;Turner,J.,《生物聚合物》,24427(1985)
[23] Ooi,T。;Obatake,M。;Nemethy,G。;Scheraga,H.A.,程序。美国国家科学院。科学。美国,83086(1987)
[24] 维拉,J。;威廉姆斯,R.L。;巴斯克斯,M。;Scheraga,H.A.,《蛋白质结构》。功能。遗传学。,10, 199 (1991)
[25] Wesson,L。;艾森伯格,D.,蛋白质科学。,1, 227 (1992)
[26] 希弗,C.A。;考德威尔,J.W。;科尔曼,P.A。;Stroud,R.M.,摩尔模拟。,10, 121 (1993)
[27] Mitsutake,A。;Okamoto,Y.,J.化学。物理。,112, 10638 (2000)
[28] N.A.Alves,U.H.E.Hansmann,人工肽中螺旋的形成和折叠,化学杂志。物理学。(2002),出版中。;N.A.Alves,U.H.E.Hansmann,人工肽中螺旋的形成和折叠,J.Chem。物理学。(2002),出版中。
[29] Duan,Y。;科尔曼,P.A.,《科学》,282740(1998)
[30] McKnight,C.J。;Doehring,D.S。;松原,P.T。;Kim,P.S.,J.分子生物学。,260, 126 (1996)
[31] Schaumann,T。;布劳恩,W。;Wuthrich,K.,生物聚合物,29679(1990)
[32] Sayle,R.A。;Milner-White,E.J.,TIBS,20,374(1995)
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。