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汉斯·佩特·波勒;伯恩德·德雷舍尔

在Tcl/Tk中高效开发的灵活且易于使用的分子生物学工作台。 （英语） Zbl 1009.68859号

软件。实践与经验 30，第12期，1433-1445（2000）.
摘要：我们描述了一个分子生物学工作台的设计和实现，该工作台允许轻松集成分析工具。该软件使用提供面向对象编程的[incr-Tcl]扩展在Tcl/Tk中实现。该程序称为tkGDE，由四个主要部分组成。序列编辑器允许用户对生物分子序列执行基本编辑操作。图形注释编辑器为用户提供序列的所有注释特征的图形概述。输出管理器保留有关分析工具生成的结果的信息。bundle控件允许多个工具自动运行，将数据从一个工具传递到另一个工具。工具通过在配置文件中描述其属性而集成到系统中，这大大减少了集成所需的时间。我们提供的结果证明，Tcl/Tk被错误地判断为速度慢，不适合大型项目。为了获得足够的性能，我们利用了Tcl/Tk的特殊特性，即空闲任务和Tk画布小部件中内置的功能。该系统由182个类中34000多行[incr-Tcl]代码组成。整个开发过程大约需要一个人年的时间。

MSC公司：

68单位99 计算方法和应用
68甲19 其他编程范式（面向对象、顺序、并发、自动等）
92 C55 生物医学成像和信号处理

关键词：

生物信息工具;灵活性;面向对象程序设计;序列分析;Tcl/Tk（千立方英尺/千立方英尺）;可视化

软件：

tkGDE公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{H.-P.Pohle}和\textit{B.Drescher}，软件。，实际。专家。30，第12号，1433-1445（2000；Zbl 1009.68859）
全文： 内政部

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