桑扎·辛格；法国，安妮·玛丽；陈耀勋；保罗·法纳姆（Paul G.Farnham）。；亚历山德拉·M·奥斯特。；查特拉·戈帕拉帕 HIV的进展和传播（PATH 4.0）–一种新的基于代理的进化网络模拟，用于建模HIV传播集群。 （英语） Zbl 1471.92351号 数学。Biosci公司。工程师。 2150-2181（2021）第3期第18页. 摘要：我们介绍了HIV（PATH 4.0）的进展和传播，这是一种用于分析集群检测和干预策略的模拟工具。分子簇是指基因相似的艾滋病毒感染群体，表明艾滋病毒快速传播，需要艾滋病毒预防资源来改善健康结果和预防新感染。PATH 4.0是使用新开发的基于代理的进化网络建模（ABENM）技术和进化接触网络算法（ECNA）构建的，用于生成无标度网络。开发ABENM和ECNA是为了促进对艾滋病毒等低流行性疾病的传播网络进行模拟，这给当前的网络模拟技术带来了计算挑战。模拟传输网络对于研究网络动力学（包括集群）至关重要。我们通过将艾滋病毒诊断的模拟预测与2010-2017年国家艾滋病毒监测系统（NHSS）的估计进行比较，验证了PATH 4.0。我们还将聚类生成算法应用于PATH 4.0，以估计聚类特征，包括通过聚类状态和大小以及聚类的大小分布来估计确诊HIV感染者的分布。模拟特征与NHSS估计值吻合良好，NHSS估计使用分子方法检测2015-2017年期间确诊HIV感染者的HIV核苷酸序列簇。集群检测和应对是美国终止艾滋病毒流行战略的一个组成部分。虽然监测对检测集群至关重要，但结合监测的模型可以使我们改进集群检测方法，了解与集群增长相关的因素，并评估干预措施，以制定有效的应对策略。由于监测数据仅适用于诊断和报告的病例，因此模型是了解集群真实规模和评估关键问题的关键工具，例如集群对后续传输的相对贡献。我们认为，PATH 4.0是第一个可用于评估国家级集群检测和响应的建模工具，可以帮助制定国家战略计划。 引用于1文件 MSC公司： 92天30分 流行病学 92-08 生物学问题的计算方法 关键词：基于agent的仿真；网络建模；HIV建模；网络聚类分析；传染病建模 软件：路径4.0；艾滋病毒追踪；NetLogo公司 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{S.Singh}等人，数学。Biosci公司。工程18，编号3，2150--2181（2021；Zbl 1471.92351） 全文： 内政部 参考文献： [1] 疾病控制和预防中心。2014-2018年美国艾滋病毒估计发病率和流行率。《2020年艾滋病毒监测补充报告》；25（第1位）。可从以下位置获得：http://www.cdc.gov/hiv/library/reports/hiv-surveillance.html。2020年5月出版。2020年7月访问。 [2] 疾病控制和预防中心。2018年艾滋病毒监测报告（更新版）；第31卷。可从以下位置获得：https://www.cdc.gov/hiv/pdf/library/reports/surveillance/cdc-hiv-surveillance-report-2018-updated-vol-31.pdf。2020年5月出版。2020年9月查阅。 [3] P、 J.Acquir，测试和治疗时代艾滋病毒预防节省的寿命成本和质量调整寿命。免疫防御。综合。，64，e15-18（2013）·doi:10.1097/QAI.0b013e3182a5c8d4 [4] N、 生命体征：人体免疫缺陷病毒检测、病毒抑制和HIV预存预防的现状美国，2013-2018，MMWR Morb。凡人威利。代表，68，1117-1123（2019）·doi:10.15585/mmwr.mm6848e1 [5] 疾病控制和预防中心。预防策略降低感染或传播艾滋病毒风险的有效性。可从以下位置获得：https://www.cdc.gov/hiv/risk/estimates/proventionstrategies.html访问日期：2020年5月。 [6] C、 HIV/AIDS的进展和传播（PATH 2.0），《医学杂志》。制作。，37, 224-233 (2017) ·doi:10.1177/0272989X16668509 [7] N、 2016-2020年美国改善艾滋病毒护理和治疗对PrEP有效性的影响，J.Acquir。免疫防御。综合。，78, 399-405 (2018) ·doi:10.1097/QAI.000000000001707 [8] H、 《美国艾滋病毒传播和艾滋病模型》，Springer 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