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用EMI模型改进神经模拟。 (英语) 兹比尔1470.92049

Tveito,Aslak(编辑)等人,《可兴奋组织建模》。EMI框架。Cham:Springer。模拟弹簧简报计算。7, 87-98 (2021).
摘要:神经元的数学建模是研究神经元活动和实验方法的重要工具。然而,用于模拟神经元动力学和细胞外电位的传统建模框架提出了一些假设,在某些应用中可能需要重新考虑这些假设。在本章中,我们应用EMI模型来研究头影效应和细胞外探针对测量电位的影响。最后,我们介绍了简化的EMI模型,该模型为模拟具有复杂形态的神经元提供了一个计算效率更高的框架。
关于整个系列,请参见[Zbl 1467.92008年].

MSC公司:

92C20美元 神经生物学
92-10 生物相关问题的数学建模或模拟
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全文: 内政部

参考文献:

[1] Anastasiou CA,Perin R,Markram H,Koch C(2011),皮层神经元的短暂耦合。《自然神经科学》14(2):217
[2] Ascoli GA、Donohue DE、Halavi M(2007)《神经形态网:神经形态的中心资源》。神经科学杂志27(35):9247-9251
[3] Buccino AP、Kuchta M、Jger KH、Ness TV、Berthet P、Mardal KA、Cauwenberghs G、Tveito A(2019)神经探针的存在如何影响细胞外电位?神经工程杂志16(2):026030
[4] Cerroni D、Laurino F、Zunino P(2019)三维油藏与一维井相互作用的数学分析、有限元近似和数值求解器。GEM-国际地球数学杂志10(1):4·Zbl 1425.35032号
[5] D'Angelo C,Quarteroni A(2008)《一维和三维扩散反应方程的耦合:组织灌注问题的应用》。应用科学中的数学模型和方法18(08):1481-1504·Zbl 1359.35200号
[6] Einevoll GT、Kayser C、Logothetis NK、Panzeri S(2013)局部场电位的建模和分析,用于研究皮层电路的功能。自然评论神经科学14(11):770-785
[7] Geuzaine C,Remacle JF(2009)Gmsh:一种内置前置和后置处理设施的三维有限元网格生成器。国际工程数值方法杂志79(11):1309-1331·Zbl 1176.74181号
[8] Gouwens NW、Berg J、Feng D、Sorensen SA、Zeng H、Hawrylycz MJ、Koch C、Arkhipov A(2018)不同皮层神经元类型生物物理详细模型的系统生成。自然通信9(1):710
[9] Holt GR,Koch C(1999)通过细胞体附近的细胞外电位进行的电相互作用。计算神经科学杂志6(2):169-184·Zbl 0927.92007号
[10] Jger KH,Tveito A(2020)可兴奋细胞基于细胞的数学模型的推导。收录:Tveito A,Mardal KA,Rognes ME(编辑)《可兴奋组织建模-EMI框架》,Simula Springer计算笔记,SpringerNature
[11] Jun JJ、Steinmetz NA、Siegle JH、Denman DJ、Bauza M、Barbarits B、Lee AK、Anastassiou CA、Andrei A、Aydñn Jo等(2017)用于神经活动高密度记录的全集成硅探针。自然551(7679):232-236
[12] Kuchta M,Mardal KA(2020)基于细胞的EMI模型的迭代求解器。In:Tveito A,Mardal KA,Rognes ME(eds)可兴奋组织建模-EMI框架,Simula Springer计算笔记,SpringerNature
[13] Kuchta M,Laurino F,Mardal KA,Zunino P(2020)与拉格朗日乘子耦合的3d-1d域上混合维偏微分方程的分析和近似。arXiv预打印arXiv:200402722·Zbl 1460.35109号
[14] Kuchta M,Mardal KA,Rognes ME(2020)使用有限元方法求解EMI方程。收录:Tveito A,Mardal KA,Rognes ME(编辑)《可兴奋组织建模-EMI框架》,Simula Springer计算笔记,SpringerNature
[15] Laurino F,Zunino P(2019)拓扑模型约简引起的高维间隙流形上耦合偏微分方程的推导和分析。ESAIM:M2AN 53(6):2047-2080·Zbl 1435.35155号
[16] Markram H等人(2015)新皮质微电路的重建和模拟。单元格163(2):456-492
[17] Mörschel K,Breit M,Queisser G(2017)使用AnaMorph生成详细三维模拟的神经元几何。神经信息学15(3):247-269
[18] Ramaswamy S等人(2015)《新皮质微电路协作门户:大鼠体感皮层的资源》。神经电路的前沿9
[19] Sterratt D、Graham B、Gillies A、Willshaw D(2011)《神经科学计算建模原理》。剑桥大学出版社
[20] Tveito A,Jger KH,Kuchta M,Mardal KA,Rognes ME(2017)心脏组织中电传导数值建模的基于细胞的框架。物理学前沿5:48
[21] Tveito A,Jger KH,Lines GT,PaszkowskiŁ,Sundnes J,Edwards AG,Míaki-Marttunen T,Halnes G,Einevoll GT(2017)《计算神经元膜电位和细胞外电位的经典模型准确性评估》。计算神经科学前沿11:27
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