卡里·克里扎克·哈雷;伊文德·巴克;斯尔詹·朱罗维奇;再见,Anja;Einar Ryeng;乌尔里克·维瑟夫;奥勒·A·安德烈森。;米特·兰加斯 使用广义线性模型的得分测试在全基因组关联研究中进行计算效率高的家庭错误率控制。 (英语) Zbl 1467.62164号 扫描。J.统计。 第41090-113号第47页(2020年). 摘要:在遗传关联研究中,检测表型-基因关联是一个主要目标。我们假设数据(表型、遗传标记和环境协变量)之间的关系可以用广义线性模型建模。标记物的数量允许远远大于研究个体的数量。多变量得分统计用于测试每个标记与表型的关联。我们假设在没有表型-基因型关联的完全零假设下,检验统计量渐近遵循多元正态分布。我们提出了家庭错误率阶(k)近似方法,以找到每个测试的局部显著性水平(或者,调整后的(p)值),从而控制家庭错误率。特殊情况\(k=1\)给出了Šidák方法。作为副产品,可以定义有效数量的独立测试。此外,如果环境协变量和遗传标记不相关,或者不存在环境协变量,我们表明得分统计之间的协方差仅取决于遗传标记。这不仅导致了更有效的计算,而且还导致了局部显著性水平,该水平仅由所用标记的集合决定,与手头实验的表型和环境协变量无关。 MSC公司: 62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析 62J12型 广义线性模型(逻辑模型) 62H20个 关联度量(相关性、典型相关性等) 62-08 统计问题的计算方法 关键词:独立测试的有效次数;FWER控制;广义线性模型;全球水资源系统;交集近似;HUNT研究 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{K.K.Halle}等人,Scand。J.Stat.47,No.4,1090--1113(2020;Zbl 1467.62164) 全文: 内政部 arXiv公司