德容,T.G。;霍尔肖夫,J。;普洛克特,G。 通过粘性薄板近似模拟真菌菌丝尖端生长。 (英语) Zbl 1464.92081号 J.西奥。生物。 492,文章ID 110189,13 p.(2020). 小结:在本文中,我们提出了一种新的单细胞、无分枝菌丝顶端生长模型。菌丝细胞的生长机制包括将细胞壁构建材料运输到细胞壁,然后在到达时将这种材料掺入细胞壁。为了模拟细胞壁构建材料向细胞壁的传输,我们遵循Bartnicki-Garcia和Gierz的假设,假设细胞壁构建物质由各向同性点源沿直线传输。为了模拟细胞壁的动力学,包括新材料对细胞壁的生长,我们使用了Campás和Mahadevan的方法,该方法假设细胞壁是一个由压差维持的粘性薄片。此外,我们还包括一个新的方程,该方程模拟了细胞壁随着年龄增长而硬化的过程。通过与实验数据的比较,我们验证了新模型。 引用于2文件 MSC公司: 92立方37 细胞生物学 92立方厘米 生物力学 34C60个 常微分方程模型的定性研究与仿真 关键词:菌丝生长;粘性薄板;细胞壁生长 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{T.G.de Jong}等人,J.Theor。生物学492,文章ID 110189,13 p.(2020;Zbl 1464.92081) 全文: 内政部 arXiv公司 链接 参考文献: [1] Bartnicki-Garcia,S.,《菌丝顶端生长:悬而未决的问题》,(Osiewacz,H.D.,真菌发育的分子生物学(2002),马塞尔·德克尔) [2] Bartnicki Garcia,S。;Bracker,C。;吉尔兹,G。;Lopez-Franco,R。;Lu,H.S.,《真菌菌丝生长的绘图:顶端生长期间的正交细胞壁扩张和膨胀压力的作用》,生物物理。J.,79,5,2382-2390(2000) [3] Bartnicki-Garcia,S。;Gierz,G.,基于囊泡供应中心概念的真菌形态发生三维模型,J.Theor。生物学,208151-164(2001) [4] Bartnicki-Garcia,S。;赫格特,F。;Gierz,G.,真菌形态发生的计算机模拟和菌丝(顶端)生长的数学基础,原生质体,153,1-2,46-57(1989) [5] Bartnicki-Garcia,S。;Lippman,E.,《真菌形态发生:毛霉细胞壁的构建》,《科学》,165302-304(1969) [6] Bartnicki-Garcia,S。;Lippman,E.,《真菌菌丝尖端的破裂趋势:顶端生长中壁合成和壁溶解之间微妙平衡的假定证据》,J.Gen.Microbiol。,73487-500(1972年) [7] 坎帕斯,O。;Mahadevan,L.,尖端生长细胞的形状和动力学,Curr。生物学,192102-2107(2009) [8] 杜梅斯,J。;Long,S.R。;Shaw,S.L.,金针菇根毛表面膨胀各向异性的力学,植物物理学。,136, 3266-3275 (2004) [9] Eggen,E。;de Keijzer,M.N。;Mulder,B.M.,《叶尖生长中的自我调节:细胞壁老化的作用》,J.Theor。生物学,283,1,113-121(2011)·Zbl 1397.92160号 [10] 费维尔,M。;Rougier,M.,Saprolegnia菌丝细胞壁合成的放射自显影研究,Arch。微生物学。,131, 212-215 (1982) [11] Girbartt,M.,Lebendbeobashtungen on Polystictus Versicolor(L.),《植物志》,142,540-563(1955) [12] Girbartt,M.,Der Spitzenkörper von Polystictus Versicolor(L.),植物,50,47-59(1957) [13] Girbartt,M.,《pilzhyphen apiklaregion von ultrastruktur der pilzhyphur》,《Proplasma》,第67期,第413-441页(1969年) [14] Gooday,G.W.,一些真菌菌丝生长的放射自显影研究,J.Gen.Microbiol,67,125-133(1971) [15] Gooday,G.W。;Gow,N.A.R.,真菌顶端生长的酶学,(Heath,I.B.,《植物和真菌细胞顶端生长》(1990),学术出版社:圣地亚哥学术出版社),31-58 [16] Gordon,C.L。;阿彻,D.B。;杰内斯,D.J。;杜南,J.H。;威尔斯,B。;Trinci,A.P.J。;Robson,G.D.,《糖化酶:GFP基因融合研究黑曲霉单个菌丝的蛋白质分泌》,微生物学杂志。方法,42,39-48(2000) [17] Gordon,C.L。;哈拉吉,V。;A.F.J.拉姆。;阿彻,D.B。;布鲁克曼,J.L。;Trinci,A.P.J。;Jeenes,D。;杜南,J.H。;威尔斯,B。;彭特,P.J。;范登·洪德尔,C。;Robson,G.D.,《糖化酶:监测黑曲霉和微生物中蛋白质分泌的绿色荧光蛋白融合》。英国,146,415-426(2000) [18] Goriely,A.,《生物生长的数学和力学》,跨学科应用数学,45(2017),Springer:Springer New York·Zbl 1398.92003号 [19] Goriely,A。;Tabor,M。;Tongen,A.,丝状生物菌丝顶端生长的形态塑性模型,(Garikipati,K.;Arrudar,E.,IUTAM细胞、分子和组织力学研讨会(2004),Springer:Springer-Dordrecht),232-260 [20] Harold,F.M.,《力与顺应:重新思考壁细胞的形态发生》,真菌遗传学。生物学,37271-282(2002) [21] Howell,P.D.,《伸展薄层流》(1994),牛津大学博士论文 [22] Hudson,H.J.,《真菌生物学》(1992),剑桥大学出版社:剑桥大学出版社 [23] 德容,T。;普罗科特,G。;Hulshof,J.,使用薄粘性板方程的真菌菌丝生长新模型,国际会议论文集Comfos(2016) [24] 德容,T。;Sterk,A。;Guo,F.,用于数据驱动验证的菌丝尖端生长计算数值方法,IEEE Access,753766-53776(2019) [25] de Keijzer,M.N。;埃蒙斯,A.M。;Mulder,B.M.,《模拟尖端增长:向前推进》(Ketelaar,T.;Emons,A.M.,Root Hairs(2009),Springer:Springer Berlin),第103-122页 [26] Koch,A.,链霉菌和真菌菌丝生长问题,J.Theor。生物学,171137-150(1994) [27] Lew,R.R。;Levina,N.N.,粗糙神经孢子菌渗透敏感性切割突变体的膨压调节,微生物学,1511530-1537(2007) [28] Lew,R.R。;列维纳,N.N。;Walker,S.K。;Garrill,A.,菌丝生物中的膨胀调节,真菌遗传学。生物学,15007-2015(2005) [29] McClure,K。;帕克·D。;Robinson,P.M.,真菌体细胞菌丝的顶端组织,J.Gen.Microbiol。,50, 177-182 (1986) [30] McDaniel,D.P。;Roberson,R.W.,微管是真菌基因Allomyces macrogynus菌丝顶端细胞中小泡和线粒体的运动和定位所必需的。《生物学》,31,233-244(2000) [31] Money,N.P.,《菌丝生长机理的见解》,《真菌生物学》。版本,22,71-76(2008) [32] 货币,N.P。;Harold,F.M.,《两个水霉菌可以在没有可测量的膨压的情况下生长》,Planta,190426-430(1993) [33] 货币,N.P。;Hill,T.W.,卵菌菌丝内切葡聚糖酶分泌与细胞壁强度的相关性:对生长和形态发生的影响,《菌物学》,89,777-785(1997) [34] Pipkin,A.C.,膜理论中方程的积分,ZAMP,19,5,818-819(1968)·Zbl 0207.24103号 [35] 拉斯特·D·M。;Horsch,M。;Gooday,G.W.,毛霉指数生长菌丝体中的复杂甲壳素降解系统:特性和功能,《微生物遗传学杂志》。,1372797-2810(1991年) [36] 里克尔梅,M。;Bredeweg,E.L。;加利福尼亚州Callejas-Negrete。;Roberson,R.W。;路德维希,S。;Beltrán-Aquilar,A。;塞勒,S。;诺维克,P。;Freitag,M.,《粗糙脉孢菌外囊复合体在极化生长期间将Spitzenkörper囊泡栓接到顶端质膜》,《分子生物学》。单元格。,25, 8, 1312-1326 (2014) [37] Steinberg,G.,《脑桥生长:马达、脂类和斯皮岑科珀的故事》,真核生物。细胞,6,3,351-360(2007) [38] Taiz,L。;Zeiger,E.,Plany Physiology(2006),Sinauer Associates Inc.出版社:Sinauer Associates Inc.出版社,马萨诸塞州 [39] 威尔登,J。;Sánchez-Leon,E。;Rico-Ramírez,A.M。;马丁·努涅斯,L。;Fajardo-Somera,R.A。;Riquelme,M.,《离墙:粗糙脉孢菌菌丝形态发生的韵律和原因》,《细胞表面》,5(2019) [40] 韦塞尔斯,J.G。;Sietsma,J.H。;Sonnenberg,A.S.,《精神分裂症菌丝形态发生期间的壁合成和组装》,《微生物遗传学杂志》。,129, 1607-1616 (1983) 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。