×

前馈网络中稳态和分岔的重合性。 (英语) Zbl 1435.34050号

小结:平衡是一种重要而常见的生物现象,在这种现象中,当输入参数在一段时间内发生变化时,输出变量变化不大。可以通过将注意力限制在动态平衡点上进行研究,即输出变量对输入参数的导数为零的点。在前馈网络中,如果一个节点有一个内稳态点,那么下游节点将继承它。这种情况下,除非下游节点的分岔点与内稳态点重合。我们应用奇异性理论研究这些稳态分岔点附近下游节点的行为。发现了低余维稳态分岔点的展开。在稳态分岔的情况下,行为包括由滞后开关分隔的多个稳态平台。在Hopf分岔的情况下,下游节点可能具有具有宽范围近恒定振幅和周期的极限环。因此,Homeostasis分叉是一种机制,通过这种机制,生物系统中可能会出现二进制、开关式响应或稳定的时钟节律。

MSC公司:

34C60个 常微分方程模型的定性研究与仿真
34二氧化碳 积分曲线、奇点、常微分方程极限环的拓扑结构
34C23型 常微分方程的分岔理论
32S30型 复杂奇点的变形;消失循环
92秒20 生物研究、人工生命和相关主题中的神经网络

软件:

MATCONT公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
全文: 内政部

参考文献:

[1] Antoneli,F.、Golubitsky,M.和Stewart,I.[2018]“前馈环基因调控基序中的稳态”,J.Theoret。生物学.445,103-109·Zbl 1397.92179号
[2] Bass,J.和Takahashi,J.S.[2010]“代谢和能量学的昼夜节律整合”,《科学》3301349-1354。
[3] Dhooge,A.、Govaerts,W.、Kuznetsov,Y.A.、Meijer,H.G.和Sautois,B.[2008]“动力系统分岔分析软件matcont的新特性”,数学。计算。模型。动态。系统14,147-175·Zbl 1158.34302号
[4] Dibner,C.、Sage,D.、Unser,M.、Bauer,C.、D'Eysmond,T.、Naef,F.和Schibler,U.[2008]“昼夜节律基因表达对整体转录率的大幅波动具有弹性,”EMBO J.28,123-134。
[5] Donovan,G.M.【2018】“Braess悖论的生物学版本源于扰动的稳态,”Phys。修订版E98,062406。
[6] Duncan,W.、Best,J.、Golubitsky,M.、Nijhout,H.和Reed,M.[2018]“尽管不稳定,但仍保持平衡”,数学。生物科学300,130-137·Zbl 1392.92024号
[7] Golubitsky,M.和Schaeffer,D.G.[1985]分岔理论中的奇点和群:第一卷,第51卷(纽约州斯普林格-Verlag)·Zbl 0607.35004号
[8] Golubitsky,M.和Stewart,I.[2016],“平衡、奇点和网络”,《数学杂志》。生物学74,387-407·兹比尔1369.92040
[9] Mulukutla,B.C.,Yongky,A.,Daoutidis,P.&Hu,W.-S.[2014]“糖酵解途径的双稳定性作为能量代谢的生理开关”,《公共科学图书馆·综合》第9卷,第1-12页。
[10] Reed,M.、Best,J.、Golubitsky,M.,Stewart,I.和Nijhout,H.F.[2017]“生化网络中的稳态机制分析”,公牛。数学。生物.792534-2557·Zbl 1382.92131号
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。