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估算贝叶斯因子的热力学积分和阶梯采样方法:教程。 (英语) Zbl 1431.62521号

摘要:执行模型选择的一种更具原则性的方法是通过贝叶斯因子。然而,计算贝叶斯因子需要边际似然,而边际似然是整个参数空间上的积分,这使得估计具有多个参数的模型的贝叶斯因素成为一个重大的计算挑战。在这里,我们提供了两种在心理学中很少使用的蒙特卡洛技术的教程回顾,这两种技术可以有效地计算边际可能性:热力学积分[N.炸薯条A.N.佩蒂特、J.R.Stat.Soc.、Ser。B、 统计方法。70,第3期,589–607(2008年;Zbl 05563360号);N.Lartillot公司H.菲利普,“使用热力学积分计算贝叶斯因子”,系统。生物学55,第2期,195-207(2006;doi:10.1080/10635150500433722)]和台阶石取样[谢伟东(W.Xie)等,“改进贝叶斯系统发育模型选择的边际似然估计”,系统。生物学60,第2期,150–160(2011;doi:10.1093/sysbio/syq085)]. 这些方法是通用的,可以很容易地在现有的MCMC代码中实现;我们为感兴趣的读者提供了实现的细节和相关的R代码。贝叶斯工具包实现标准统计分析(例如,JASP团队,2017;R.D.莫雷J.N.鲁德,“贝叶斯因子:常见设计的贝叶斯因素计算”(2015;https://cran.r-project.org/package=BayesFactor)]通常为研究人员计算贝叶斯因子,那些使用贝叶斯方法评估认知模型的人通常留给自己计算贝叶斯因子。在这里,我们提供了计算中等复杂选择响应时间模型(线性弹道累加器模型)的边际可能性的方法示例[S.D.Brown(S.D.布朗)A.希斯克特,“选择响应时间的最简单完整模型:线性弹道累积”,Cogn。精神病。57,第3号(2008年;doi:10.1016/j.cogpsych.2007.12.002)],并将其与[N.J.埃文斯S.D.Brown(S.D.布朗),“线性弹道累加器决策模型的贝叶斯因子”,Behav。研究方法50,No.2,589–603(2017;doi:10.3758/s13428-017-0887-5)]他使用了蛮力技术。然后,我们在层次结构框架内给出了TI和SS的推导,提供了使用层次模型的模型恢复案例研究的结果,并展示了对经验数据的应用。开放科学框架提供了配套的R包:https://osf.io/jpnb4.

MSC公司:

第62页第15页 统计学在心理学中的应用
2015年1月62日 贝叶斯推断
65二氧化碳 蒙特卡罗方法

引文:

Zbl 05563360号
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