P.J.、Murray;F.A.,Carrieri公司;J.K.,戴尔 细胞周期对振荡的调节在前中胚层的计算模型中产生生长和形态的耦合。 (英语) 兹比尔1422.92019 J.西奥。生物。 481, 75-83 (2019). 小结:脊椎动物胚胎的分割过程中,生长和形态之间的耦合是一个引人注目的例子。在分割过程中,成对的节段(一个位于前后轴的两侧)在一定的时间间隔内从颞前中胚层(PSM)萌芽。在时钟和波前模型中,多细胞振荡器调节下一对片段形成的时间,而波前调节它们的空间位置。在大多数分割的数学模型中,假设PSM中的单元是具有恒定固有频率的振荡器。基于最近的实验结果,我们提出了一个模型,其中每个PSM细胞的自然振荡频率是其在细胞周期中位置的函数。假设有足够的振荡器耦合,并且PSM中的细胞在细胞周期中随机分布,我们发现出现的振荡器频率是组成振荡器频率的加权平均值,其权重取决于给定细胞周期状态中细胞的比例。在这里,我们表明这样的模型可以考虑PSM组织中图案形成和生长速度之间的耦合。 MSC公司: 92立方厘米 发育生物学,模式形成 92-08 生物学问题的计算方法 关键词:眼前中胚层;耦合振荡器;体细胞发生时钟;新生儿重症监护室;细胞周期;时钟和波前模型 软件:贞洁 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{M.P.J.}等人,J.Theor。生物学481,75-83(2019;Zbl 1422.92019) 全文: 内政部 链接 参考文献: [1] 卡里耶里,F.A。;P.J.Murray。;Ditsova,D。;费里斯医学硕士。;戴维斯,P。;Dale,J.K.,CDK1和CDK2调节NICD周转和细分时钟的周期,EMBO代表,e46436(2019) [2] 科利尔,J.R。;McInerney,D。;Schnell,S。;Maini,P.K。;Gavaghan,D.J。;宾夕法尼亚州休斯顿。;Stern,C.D.,《体细胞发生的细胞周期模型:数学公式和数值模拟》,J.Theor。生物,207,3,305-316(2000) [3] 库克,J.,脊椎动物非洲爪蟾形态发生过程中体节数量的控制,《自然》,254,5497,196(1975) [4] 库克,J。;塞曼,E.C.,《动物形态发生过程中控制重复结构数量的时钟和波前模型》,J.Theor。生物学,58,2455-476(1976) [5] 德劳恩,E.A。;弗朗索瓦,P。;Shih,N.P。;Amacher,S.L.,缺口信号和有丝分裂对分段时钟动力学影响的单细胞分辨率成像,Dev.cell,23,5,995-1005(2012) [6] Dequéant,M.-L。;Glynn,E。;高登茨,K。;Wahl,M。;陈,J。;Mushegian,A。;Pourquié,O.,《小鼠分段时钟下信号基因的复杂振荡网络》,《科学》,31458051595-1598(2006) [7] D’Souza,B。;Meloty-Kapella,L。;Weinmaster,G.,规范和非规范缺口配体,Curr。顶部。开发生物。,92, 73-129 (2010) [8] Z.费延齐克。;Hayashi,S。;Dale,J.K。;Bessho,Y。;Herreman,A。;De Strooper,B。;德尔蒙特,G。;de la Pompa,J.L。;Maroto,M.,Notch是小鼠体细胞发生振荡器的关键成分,对体细胞的形成至关重要,PLoS Genet。,5、9、e1000662(2009) [9] Fletcher,A.G.,《从亚细胞到组织尺度的肿瘤建模方面》(2010),牛津大学 [10] Gibb,S。;Maroto,M。;Dale,J.K.,《分段时钟机制上了一个台阶》,《趋势细胞生物学》。,20, 10, 593-600 (2010) [11] Hori,K。;Sen,A。;Artavanis-Tsakonas,S.,《Notch信号一览》,J.Cell Sci。,126, 10, 2135-2140 (2013) [12] Horikawa,K。;Ishimatsu,K。;Yoshimoto,E。;Kondo,S。;Takeda,H.,分段时钟的抗噪声和同步振荡,《自然》,441,7094,719(2006) [13] Hubaud,A。;Pourquié,O.,脊椎动物分割中的信号动力学,《分子细胞生物学》。,15, 11, 709 (2014) [14] 石松,K。;Hiscock,T.W。;柯林斯,Z.M。;D.W.K.萨里。;Lischer,K。;里士满,D.L。;Bessho,Y。;松井,T。;Megason,S.G.,大小诱导胚胎揭示了斑马鱼体节形成的基于梯度缩放的机制,《发育》,145,11(2018) [15] 姜永杰。;Aerne,B.L。;Smithers,L。;哈登,C。;Ish-Horowicz,D。;Lewis,J.,Notch信令和体节分割时钟的同步,《自然》,408,6811,475(2000) [16] Krol,A.J。;Roellig,D。;Dequéant,M.-L。;O.塔西。;Glynn,E。;哈特姆·G。;Mushegian,A.(木舍吉安,A.)。;奥茨,A.C。;Pourquié,O.,分段时钟网络的进化可塑性,Development,138,13,2783-2792(2011) [17] Lauschke,V.M。;齐亚利斯,哥伦比亚特区。;弗朗索瓦,P。;Aulehla,A.,基于相位-颗粒编码的胚胎模式缩放,《自然》,493,7430,101(2013) [18] Masamizu,Y。;大冢,T。;Y.高岛。;Nagahara,H。;Takenaka,Y。;吉川,K。;冈村,H。;Kageyama,R.,体节分割时钟的实时成像:揭示单个节前中胚层细胞中的不稳定振荡器,Proc。国家。阿卡德。科学。,103, 5, 1313-1318 (2006) [19] Morelli,L.G。;阿瑞斯,S。;Herrgen,L。;施罗德,C。;Jülicher,F。;Oates,A.C.,脊椎动物分割的延迟耦合理论,HFSP J.,3,1,55-66(2009) [20] P.J.Murray。;Maini,P.K。;Baker,R.E.,《重新审视时钟和波前模型》,J.Theor。生物学,283,1227-238(2011)·Zbl 1397.92086号 [21] P.J.Murray。;Maini,P.K。;Baker,R.E.,斑马鱼体细胞发生期间三角洲缺口扰动建模,Dev.Biol。,373, 2, 407-421 (2013) [22] 大久保,Y。;苏加瓦拉,T。;Abe-Koduka,N。;Kanno,J。;木村,A。;Saga,Y.,Lfng通过转换缺口信号调节小鼠分段时钟的同步振荡,Nat.Commun。,3, 1141 (2012) [23] 皮特·弗兰西斯,J。;Pathmanathan,P。;M.O.伯纳乌。;博尔达斯,R.A。;库珀,J.A。;弗莱彻,A。;米拉姆斯,G。;默里,P.J。;奥斯本,J.M。;Walter,A。;查普曼,S。;Garny,A。;范列文,I。;Maini,P.等人。;罗德里格斯,B。;沃特斯,S。;怀特利,J。;Byrne,H。;Gavaghan,D.,Chaster:生物建模软件开发的测试驱动方法,计算。物理学。社区。,180, 12, 2452-2471 (2009) ·Zbl 1197.68038号 [24] Pourquié,O.,鸡胚中Somite的形成。,国际开发生物学杂志。,62, 1-2-3, 57-62 (2018) [25] Primmett,D.R。;诺里斯·W·E。;卡尔森·G·J。;凯恩斯,R.J。;Stern,C.D.,鸡胚热休克引起的周期性节段性异常与细胞周期相关,《发育》,105,1,119-130(1989) [26] Primmett,D.R。;斯特恩,C.D。;凯恩斯,R.J.,《热休克导致鸡胚重复出现节段性异常》,《发育》,104,2,331-339(1988) [27] Soroldoni,D。;Jörg,D.J。;Morelli,L.G。;里士满,D.L。;辛德林,J。;Jülicher,F。;Oates,A.C.,《胚胎模式形成中的多普勒效应》,《科学》,3456193222-225(2014) [28] 魏德曼,G。;骨,R.A。;席尔瓦,J.C。;比约克伦德,M。;P.J.Murray。;Dale,J.K.,《积极和消极监管机构的平衡决定了细分时钟的速度》,eLife,4,e05842(2015) 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。