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玛丽亚姆·埃斯马埃利;哈桑·穆罕默德;萨珊·莫森扎德

使用周伪氨基酸组成的概念预测人乳头瘤病毒的风险类型。 （英语） Zbl 1406.92455号

J.西奥。生物。 263，第2期，203-209（2010）.
摘要：高危型人乳头瘤病毒（HPV）是几乎所有宫颈癌病例（99.7%）的病因，HPV E6蛋白是几乎所有HPV阳性癌症中表达的两种病毒癌蛋白之一。因此，对HPV的风险类型进行分类对于宫颈癌的诊断和治疗是非常有用和必要的。为了通过生物信息学分析预测和分类HPV的风险类型，从现有数据库中获得了96个E6蛋白序列。采用PseAAC服务器、ROC曲线和统计分析方法研究这些序列的风险类型。我们的分类基于HPV E6蛋白的一些特征，如疏水性、亲水性、侧链质量、α-COOH组的PK、α-NH组的PK和25℃的PI。还预测了4种未知HPV类型和25种未报告的HPV类型的风险类型。这些结果表明，基于生物信息学的理论方法可以指导和简化实验研究。

引用于45文件

MSC公司：

92D20型 蛋白质序列，DNA序列
62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析

关键词：

E6蛋白;生物信息学;低风险;高风险

软件：

GPCR-CA公司;欧盟-mPLoc;PseAAC公司;信号-CF;信号-3L;四叉戟;位置传感器;Hum-位置;欧洲公共图书馆;ProtIdent公司;Memtype-2L型;Nuc-ploc（数字）
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\textit{M.Esmaeili}等人，J.Theor。生物学263，第2期，203--209（2010；Zbl 1406.92455）
全文： 内政部

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