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酵母细胞周期模型的随机Petri网扩展。 (英语) Zbl 1400.92341号

摘要:本文介绍了基于随机Petri网(SPN)的芽殖酵母细胞周期随机模型的定义、求解和验证。选择一个特定的SPN家族来构建一个成熟确定性模型的随机版本。我们描述了从确定性ODE模型定义SPN模型所遵循的过程,该过程可以在很大程度上实现自动化。根据确定性模型提供的结果和文献中的实验结果,对SPN模型进行了验证。SPN模型捕捉野生型芽殖酵母细胞和各种突变体的行为。我们表明,随机模型与芽苗酵母细胞的一些特征相匹配,而确定性模型无法找到这些特征。SPN模型对仿真结果进行了微调,丰富了其结果的广度和质量。

MSC公司:

92C99型 生理、细胞和医学主题
92立方厘米 系统生物学、网络
68问题85 并发和分布式计算的模型和方法(进程代数、互模拟、转换网等)
60华氏30 随机分析的应用(PDE等)

软件:

SPNP公司
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全文: 内政部

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