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郭在义；Peter M.A.Sloot。；泰乔辛

基于混合代理的微生物系统建模方法。 （英语） Zbl 1400.92209号

J.西奥。生物。 255，第2号，163-175（2008）.
概述：系统生物学模型通常采用微分方程或基于代理的建模方法来模拟整个过程。基于微分方程的模型预设了现象学细胞内行为机制，而基于多智能体方法的模型通常使用直接翻译的、定量上不太精确的if-then逻辑规则构造。我们提出了一种基于混合代理方法的可扩展系统模型，其中生物细胞被建模为个体（代理），而分子由量表示。实体表示中的这种混合需要一种与基于代理的行为规则和微分方程相结合的建模策略，从而平衡可扩展模型粒度和计算可处理性的要求。我们用趋化性模型证明了这种方法的有效性，该模型涉及对细胞和分子的分析。该模型产生的细胞迁移模式与实验室观察结果相当。

引用于4文件

MSC公司：

第92页第42页 系统生物学、网络
92C45型 生化问题中的动力学（药代动力学、酶动力学等）
92立方37 细胞生物学
92立方厘米 细胞运动（趋化性等）

关键词：

多层仿真模型；趋化性；低糖测定；受体动力学

软件：

代理单元格
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\textit{Z.Guo}等人，J.Theor。生物学255，No.2，163--175（2008；Zbl 1400.92209）
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