×
周海明；蒂莫西·汉森

将贝叶斯半参数模型拟合到任意删失的生存数据（包括空间参考数据）的统一框架。 （英语） Zbl 1398.62266号

美国统计协会。 113，编号522571-581（2018）.
摘要：针对三种最常用的半参数模型：比例风险、比例赔率和加速失效时间，提出了一种综合、统一的建模任意删失空间生存数据的方法。与许多其他方法不同，所有形式的删失生存时间都是同时适应的，包括未删失、间隔删失，当前状态，左删失和右删失以及这些的混合。左截断数据也可用于时间相关协变量的模型。处理地理参考（精确观测的位置）和区域观测（地理单位（如县）已知的位置）空间位置；形式变量选择使模型选择变得特别容易。模型拟合通过条件Cox–Snell残差图进行评估，并通过对数伪边际似然（LPML）和偏差信息准则（DIC）进行模型选择。基线存活率用一种新的变换Bernstein多项式先验建模。所有模型都通过一个新函数进行拟合，该函数调用R包中高效编译的C++。该方法通过仿真和实际数据应用进行了广泛的说明。一个重要的发现是，比例概率和加速失效时间模型通常比常用的比例风险模型更适合。本文的补充材料，包括可用于复制作品的材料的标准化描述，可作为在线补充提供。

引用于1审查
引用于7文件

MSC公司：

62N01号 审查数据模型
62-04 统计相关问题的软件、源代码等
2015年1月62日 贝叶斯推断
62米10 统计学中的时间序列、自相关、回归等（GARCH）
62立方米 从空间过程推断
62号05 可靠性和寿命测试

关键词：

伯恩斯坦多项式；区间截断数据；空间脆弱性模型；变量选择

软件：

对；化学需氧量；mcmcse公司；贝叶斯X；R-INLA公司；ICBayes公司；spBayes Surv公司；spBayes公司；FRK公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{H.Zhou}和\textit{T.Hanson}，J.Am.Stat.Assoc.113，No.522，571--581（2018；Zbl 1398.62266）
全文： 内政部 arXiv公司

参考文献：

[1] Antoniak，C.E.，Dirichlet过程的混合及其在贝叶斯非参数问题中的应用，统计年鉴, 2, 1152-1174, (1974) ·Zbl 0335.60034号
[2] 阿尔比亚，G。；埃斯帕，G。；朱利安尼，D.，《健康和制药公司生存的空间分析》，应用统计学杂志, 44, 1560-1575, (2017) ·Zbl 1516.62124号
[3] 阿松诺，R。；Krainski，E.，贝叶斯空间模型中的邻域依赖，生物医学杂志, 51, 851-869, (2009) ·Zbl 1442.62242号
[4] 巴尔塔扎尔·阿班，I。；Pena，E.A.，基于危险的残留物的特性和模型诊断的意义，美国统计协会杂志, 90, 185-197, (1995) ·Zbl 0820.62085号
[5] 班纳吉，S。；卡林，B.P。；Gelfand，A.E。，空间数据的层次化建模与分析，（2014），查普曼和霍尔/CRC出版社，佛罗里达州博卡拉顿
[6] 班纳吉，S。；盖尔芬德，A.E。；芬利，A.O。；Sang，H.，大空间数据集的高斯预测过程模型，，英国皇家统计学会杂志, 70, 825-848, (2008) ·兹伯利05563371
[7] 班纳吉，S。；沃尔，M.M。；Carlin，B.P.，空间相关生存数据的脆弱建模，及其在明尼苏达州婴儿死亡率中的应用，生物统计学, 4, 123-142, (2003) ·Zbl 1142.62420号
[8] Belitz，C。；Brezger，A。；克莱因，N。；Kneib，T。；朗·S。；北欧姆劳夫。，BayesX-结构加性回归模型中的贝叶斯推理软件，3.0版，（2015年）
[9] Besag，J.，晶格系统的空间相互作用和统计分析，，英国皇家统计学会杂志, 36, 192-236, (1974) ·Zbl 0327.60067号
[10] 蔡，B。；林，X。；Wang，L.，当前状态数据的单调样条贝叶斯比例风险模型，计算统计与数据分析, 55, 2644-2651, (2011) ·Zbl 1464.62034号
[11] 陈，Y。；Hanson，T。；Zhang，J.，基于伯恩斯坦多项式广义参数族的加速危险模型，生物计量学, 70, 192-201, (2014) ·Zbl 1419.62324号
[12] Cox，D.R.，回归模型和生命表（含讨论），，英国皇家统计学会杂志, 34, 187-220, (1972) ·Zbl 0243.62041号
[13] 考克斯·D·R。；Snell，E.J.，残差的一般定义，，英国皇家统计学会杂志, 30, 248-275, (1968) ·Zbl 0164.48903号
[14] 北卡罗来纳州克雷西。；Johannesson，G.，超大空间数据集的固定秩克里金，，英国皇家统计学会杂志, 70, 209-226, (2008) ·Zbl 05563351号
[15] Darmofal，D.，政治事件过程的贝叶斯空间生存模型，美国政治科学杂志, 53, 241-257, (2009)
[16] Diva，美国。；戴·D·K。；Banerjee，S.，多癌症患者空间相关生存数据的参数模型，医学统计学, 27, 2127-2144, (2008)
[17] Ferguson，T.S.，一些非参数问题的贝叶斯分析，统计年鉴, 1, 209-230, (1973) ·Zbl 0255.62037号
[18] Flegal，J.M。；休斯，J。；D.瓦茨。，mcmcse:MCMC的蒙特卡罗标准误差，R包版本1.2-1，（2016），加利福尼亚州河滨市和明尼阿波利斯市
[19] 盖瑟，S。；Eddy，W.F.，模型选择的预测方法，美国统计协会杂志, 74, 153-160, (1979) ·Zbl 0401.62036号
[20] Ghosal，S.，用Bernstein多项式进行密度估计的收敛速度，统计年鉴, 29, 1264-1280, (2001) ·Zbl 1043.62024号
[21] 吉尔克斯，W.R。；Wild，P.，吉布斯采样的自适应抑制采样，应用统计学, 41, 337-348, (1992) ·Zbl 0825.62407号
[22] Haario，H。；Saksman，E。；Tamminen，J.，自适应大都会算法，伯努利, 7, 223-242, (2001) ·Zbl 0989.65004号
[23] Hanson，T。；约翰逊，W。；Laud，P.，含步长过程协变量生存模型的半参数推断，加拿大统计杂志，37，60-79，（2009年）·Zbl 1170.62078号
[24] Hanson，T.E。；贾拉，A。；Zhao，L.，具有空间脆弱性的贝叶斯半参数时间分层比例风险模型，贝叶斯分析, 7, 147-188, (2012) ·Zbl 1330.62368号
[25] 亨德森，R。；Shimakura，S。；Gorst，D.，白血病生存数据的空间变异建模，美国统计协会杂志, 97, 965-972, (2002) ·Zbl 1048.62102号
[26] Hennerfeind，A。；Brezger，A。；Fahrmeir，L.，地质添加剂生存模型，美国统计协会杂志, 101, 1065-1075, (2006) ·Zbl 1120.62331号
[27] 希格顿，D。；安德森，C.W。；巴内特，V。；查特温，P.C。；El-Shaarawi，A.H。，当前环境问题的定量方法《使用过程卷积的空间和时空建模》，37-56，（2002），纽约斯普林格·Zbl 1255.86016号
[28] Jerrett，M。；伯内特，R.T。；贝克曼，B.S。；特纳，M.C。；Krewski，D。；瑟斯顿，G。；马丁·R·V。；van Donkelaar，A。；Hughes，E。；Shi，Y。；加普斯图尔，S.M。；Thun，M.J。；Pope，C.A.，加利福尼亚州空气污染和死亡率的空间分析，美国呼吸与危重病护理医学杂志, 188, 593-599, (2013)
[29] Kalbfleisch，J.，生存时间数据的非参数贝叶斯分析，，英国皇家统计学会杂志, 40, 214-221, (1978) ·Zbl 0387.62030号
[30] Kammann，E.E。；Wand，M.P.，地质添加剂模型，应用统计学, 52, 1-18, (2003) ·Zbl 1111.62346号
[31] 考夫曼，C.G。；舍维什，M.J。；Nychka，D.W.，大型空间数据集中基于相似性估计的协方差减缩，美国统计协会杂志, 103, 1545-1555, (2008) ·Zbl 1286.62072号
[32] Kneib，T.，基于混合模型的推断在间隔相关生存时间的地质加性风险回归中，计算统计与数据分析, 51, 777-792, (2006) ·Zbl 1157.62506号
[33] Kneib，T。；Fahrmeir，L.，地质加性风险回归的混合模型方法，斯堪的纳维亚统计杂志, 34, 207-228, (2007) ·Zbl 1142.62073号
[34] Komarek，A.，具有灵活分布假设的多元间隔相关数据的加速失效时间模型，（2006年）
[35] 科马雷克，A。；Lesaffre，E.，贝叶斯加速失效时间模型，具有多元双间隔敏感数据和灵活分布假设，美国统计协会杂志, 103, 523-533, (2008) ·Zbl 1469.62373号
[36] 使用具有灵活分布假设的加速失效时间模型对相关间隔相关数据图解进行回归分析，统计建模, 9, 299-319, (2009) ·Zbl 07257706号
[37] Lavine，M.，统计建模用多聚树分布的一些方面，统计年鉴, 20, 1222-1235, (1992) ·Zbl 0765.62005年
[38] 拉文，M.L。；Hodges，J.S.，关于ICAR模型的严格规范，美国统计学家, 66, 42-49, (2012) ·Zbl 07648997号
[39] 李，J。；Y.Hong。；塔帕，R。；Burkhart，H.E.，具有空间相关随机效应的火炬松存活分析，美国统计协会杂志, 110, 486-502, (2015)
[40] 李，L。；Hanson，T。；Zhang，J.，应用于前列腺癌生存的空间扩展危险模型，生物计量学, 71, 313-322, (2015) ·Zbl 1390.62283号
[41] 李毅。；Lin，X.，空间相关生存数据的半参数正态变换模型，美国统计协会杂志, 101, 591-603, (2006) ·Zbl 1119.62376号
[42] 李毅。；Ryan，L.，使用半参数脆弱性模型建模空间生存数据，生物计量学, 58, 287-297, (2002) ·Zbl 1209.62222号
[43] 林，X。；蔡，B。；Wang，L。；Zhang，《一般区间敏感数据的贝叶斯比例风险模型》，终身数据分析，21470-490，（2015年）·Zbl 1322.62133号
[44] 林，X。；Wang，L.，用于分析当前状态数据的贝叶斯比例优势模型：单变量、聚类和多变量，统计中的通信——模拟和计算, 40, 1171-1181, (2011) ·Zbl 1227.62015年
[45] 刘，Y。；Sun，D。；He，C.Z.，结直肠癌生存数据的分层条件自回归模型，威利跨学科评论：计算统计学, 6, 37-44, (2014)
[46] 马丁斯，R。；Silva，G.L。；Andreozzi，V.，艾滋病纵向和空间生存数据的贝叶斯联合建模，医学统计学，353368-3384，（2016）
[47] 马丁斯·T·G。；D.辛普森。；林格伦，F。；Rue，H.，使用INLA的贝叶斯计算：新特性，计算统计与数据分析, 67, 68-83, (2013) ·Zbl 1471.62135号
[48] Morin，A.A.，《森林火灾存活的空间分析和模拟火灾负荷的标记聚类过程》（2014）
[49] 缪勒，P。；F.金塔纳。；贾拉，A。；Hanson，T。，贝叶斯非参数数据分析，（2015），纽约斯普林格·弗拉格·Zbl 1333.62003年
[50] 默里，R.P。；Anthonisen，N.R。；康奈特，J.E。；怀斯·R·A。；林格伦，P.G。；Greene，P.G。；Nides，M.A.，多次尝试戒烟和再次吸烟对肺功能的影响，临床流行病学杂志, 51, 1317-1326, (1998)
[51] Ojiambo，P。；Kang，E.，在葫芦霜霉病流行的生存分析中建模空间脆弱性，植物病理学, 103, 216-227, (2013)
[52] O’Quigley，J。；Xu，R。；Ermitage，P。；科尔顿，T。，生物统计学百科全书《生存分析中的拟合度》，1-14，（2005），John Wiley&Sons，Ltd.，纽约
[53] Paciorek，C.，技术小插曲5：理解内在高斯马尔可夫随机场空间模型，包括内在条件自回归模型，（2009）
[54] 潘，C。；蔡，B。；Wang，L。；Lin，X.，空间相关间隔感知生存数据的贝叶斯半参数模型，计算统计与数据分析, 74, 198-209, (2014) ·Zbl 1506.62145号
[55] ICBayes:间隔检测数据的贝叶斯半参数模型，R包1.0版，（2015年）
[56] Petrone，S.，《随机伯恩斯坦多项式》，斯堪的纳维亚统计杂志, 26, 373-393, (1999) ·Zbl 0939.62046号
[57] Petrone，S.公司。；Wasserman，L.，Bernstein多项式后验的一致性，，英国皇家统计学会杂志, 64, 79-100, (2002) ·兹比尔1015.62033
[58] 普卢默，M。；贝斯特，N。；Cowles，K。；Vines，K.，CODA：MCMC的收敛诊断和输出分析，美国统计协会杂志, 6, 7-11, (2006)
[59] 普伦蒂斯，R.L。；Kalbfleisch，J.D.，具有协变量的风险率模型，生物计量学, 35, 25-39, (1979) ·Zbl 0414.62052号
[60] Sang，H。；Huang，J.Z.，大型空间数据集协方差函数的全尺度近似，，英国皇家统计学会杂志, 74, 111-132, (2012) ·Zbl 1411.62274号
[61] Sargent，D.J。；霍奇斯，J.S。；卡林，B.P.，结构化马尔可夫链蒙特卡罗，计算与图形统计杂志, 9, 217-234, (2000)
[62] Schnell，P。；Bandyopadhyay博士。；Reich，B.J。；Nunn，M.，空间生存数据的边际治愈率比例风险模型，，英国皇家统计学会杂志, 64, 673-691, (2015)
[63] 施皮盖尔哈特，D.J。；贝斯特，N.G。；卡林，B.P。；Van Der Linde，A.，模型复杂性和拟合的贝叶斯度量，，英国皇家统计学会杂志, 64, 583-639, (2002) ·Zbl 1067.62010年
[64] 孙，J。，间隔相关失效时间数据的统计分析，（2006），Springer-Verlag，纽约·Zbl 1127.62090号
[65] Taylor，B.M.，应急服务响应时间的空间建模，，英国皇家统计学会杂志, 180, 433-453, (2017)
[66] Turnbull，B.W.，具有双删失数据的生存函数的非参数估计，美国统计协会杂志, 69, 169-173, (1974) ·兹比尔0281.62044
[67] Umlauf，N。；阿德勒博士。；Kneib，T。；朗·S。；Zeileis，A.，结构化加性回归模型：贝叶斯的R接口，统计软件杂志, 63, 1-46, (2015)
[68] Wang，L。；Lin，X.，在半参数比例优势模型下分析案例2间隔相关数据的贝叶斯方法，统计与概率信件, 81, 876-883, (2011) ·Zbl 1219.62054号
[69] Wang，L。；McMahan，C.S。；哈金斯，M.G。；Qureshi，Z.P.，一种将比例风险模型拟合到区间截尾数据的灵活、计算高效的方法，生物计量学, 72, 222-231, (2016) ·Zbl 1393.62105号
[70] 王，S。；张杰。；Lawson，A.B.，贝叶斯正态混合加速失效时空模型及其在前列腺癌中的应用，医学研究中的统计方法, 25, 793-806, (2016)
[71] 赵，L。；Hanson，T.E.，生存数据的空间相关多聚树建模，生物计量学, 67, 391-403, (2011) ·Zbl 1217.62197号
[72] 赵，L。；Hanson，T.E。；Carlin，B.P.，用于灵活的空间脆弱生存建模的polya树混合物，生物特征, 96, 263-276, (2009) ·Zbl 1163.62079号
[73] 周，H。；Hanson，T。；密特拉·R。；穆勒，P。，生物统计学中的非参数贝叶斯推断，贝叶斯空间生存模型，215-246，（2015），Springer，Cham·兹比尔1334.62163
[74] spBayesSurv:空间相关生存数据的贝叶斯建模和分析，R包1.1.3版, (2018)
[75] 周，H。；Hanson，T。；贾拉，A。；Zhang，J.，使用协变量调整脆弱比例风险模型模拟县级乳腺癌生存数据，应用统计学年鉴, 9, 43-68, (2015) ·Zbl 1454.62430号
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。