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系统发育学中的保守变种。 (英语) Zbl 1375.14175号

小结:本文包含作者博士论文的一部分,并由新结果进行了修订和扩展。我们研究的主要对象是与树上的特殊马尔可夫过程自然相关的复曲面簇。这种马尔可夫过程可以由树(T)和群(G)定义。它们被称为基于组的模型。考虑这些过程的主要动机(但并非唯一)来自系统发育学。我们研究了相关复曲面簇的几何、定义方程和组合描述。我们获得了一大类不一定是阿贝尔群模型的新结果,我们称之为(G)-模型。我们还证明了四阶方程定义了表示3-Kimura模型的投影格式。

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14米25 双曲面变体、牛顿多面体、Okounkov体
13第25页 交换代数的应用(例如,统计、控制理论、优化等)
52B20型 凸几何中的格多面体(包括与交换代数和代数几何的关系)
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全文: 内政部

参考文献:

[1] [APRS11]E.S.Allman,S.Petrović,J.A.Rhodes和S.Sullivant,基于群模型的双树混合的可识别性,IEEE/ACM Trans。计算。生物学和生物信息学8(2011),710–722。
[2] [AR06]E.S.Allman和J.A.Rhodes,系统发育模型(包括共价和混合模型)树拓扑的可识别性,J.Compute。《生物学》第13期(2006年),1101-1113。84
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