克莱门斯·亚瑟·施瓦宁格;丹尼斯·门什科;达格玛·伊伯 模拟器官发生：基于图像确定位移场的算法。 （英语） Zbl 1369.92064号 ACM事务处理。模型。计算。模拟。 25，第2号，第10条，第19页（2015年）. 引用于1文件 MSC公司： 92 C55 生物医学成像和信号处理 92-08 生物学问题的计算方法 关键词：位移场;曲线映射;基于图像的建模 软件：COMSOL公司;Matlab公司;弧间;OPCODE公司;距离2曲线 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{C.A.Schwaninger}等人，ACM Trans。模型。计算。模拟。25，第2号，第10条，第19页（2015年；Zbl 1369.92064） 全文： 内政部 arXiv公司 参考文献： [1] Srivathsan Adivarahan、Denis Menshykau、Odyssé；Michos和Dagmar Iber。2013年，基于动态图像的肾分支形态发生建模。系统生物学计算方法。柏林施普林格，106-119。 [2] 马克·阿莱克萨。2002.网格变形的最新进展。计算机图形论坛21，2（2002），173-197·数字对象标识代码：10.1111/1467-8659.00575 [3] Theodoris Athanasiadis、Ioannis Fudos、Christophoros Nikou和Vasiliki Stamati。2010.基于几何约束球体映射优化的基于特征的3D变形。2010年美国计算机学会应用计算研讨会论文集（SAC’；10）。1258. ·兹伯利1244.65019 [4] Amarendra Badugu、Conradin Kraemer、Philipp Germann、Denis Menshykau和Dagmar Iber。2012.BMP受体相互作用导致肢体发育过程中的数字模式。科学报告2（2012），991·doi:10.1038/srep00991 [5] 约汉斯·贝拉ï；che，Floris Bosveld，Francois Graner，Karol Mikula，Mariana Remesí；科夫；，和Michal Smí；2011年12月。基于在分段时空细胞结构中找到理想路径的果蝇形态发生视频中跟踪细胞的新鲁棒算法。医学和生物学会工程学，EMBC，2011年IEEE年度国际会议。6609–6612. [6] Pierre Blanc、Karen Coste、Pierre Pouchin、Jean-Marc Azaï；s、 低ï；c布兰肯、丹尼斯·加洛特和文森特·萨宾。2012.间充质动力学在小鼠肺分支形态发生中的作用。《公共科学图书馆·综合》第7期、第7期（2012年），e41643。 [7] 伯恩德·博姆（Bernd Boehm）、亨利克·韦斯特伯格（Henrik Westerberg）、加亚·莱斯尼卡·普科（Gaja Lesnicar-Pucko）、萨赫迪亚·拉贾（Sahdia Raja）、迈克尔·劳茨卡（Michael Rautschka）、詹姆斯·科特雷尔（James Cotterell。2010.空间控制细胞增殖在肢芽形态发生中的作用。《公共科学图书馆·生物学》8，7（2010），e1000420。内政部：http://dx.doi.org/10.1371/journal.pbio.1000420 ·doi:10.1371/journal.pbio.1000420 [8] 弗雷德·布克斯坦（Fred L.Bookstein）。1989.主要翘曲：薄板样条和变形分解。IEEE TPAMI 2（1989），567–585·Zbl 0691.65002号 ·doi:10.1109/34.24792 [9] 杰拉尔丁·塞利埃（Geraldine Celliere）、丹尼斯·门什科（Denis Menshykau）和达格马尔·伊伯（Dagmar Iber）。2012.模拟表明，一个简单的网络足以控制肺分支形态发生过程中的分支点选择、平滑肌和血管形成。生物公开赛1、8（2012年8月），775–788·doi:10.1242/bio.20121339 [10] 拉斐ë；l氯é；芒特、皮埃尔·布朗、本杰明·莫罗伊、文森特·萨宾和圣é；芬妮·杜阿迪。2012.早期肺形态发生中的形状自我调节。《公共科学图书馆·综合》7，5（2012），e36925。 [11] 约翰·D’；埃里科。2012年a。distance2曲线功能。MATLAB Central–文件交换。检索自http://www.mathworks.in/matlabcentral/fileexchange/34869-distance2curve。 [12] 约翰·D；埃尔里科。2012年b。Interparc函数。MATLAB Central–文件交换。检索自http://www.mathworks.in/matlabcentral/fileexchange/34874-interparc。 [13] 罗伯特·狄龙（Robert Dillon）和汉斯·奥思默（Hans G.Othmer）。1999.脊椎动物肢芽生长和空间模式的数学模型。《理论生物学杂志》197，3（1999），295-330。内政部：http://dx.doi.org/10.1006/jtbi.1998.0876 ·doi:10.1006/jtbi.1998.0876 [14] 杰森·格雷霍恩（Jason P.Gleghorn）、郭继勇（Jiyong Kwak）、阿米拉·巴夫洛维奇（Amira L.Pavlovich）和塞莱斯特·尼尔森（Celeste M.Nelson）。2012.抑制形态因子和鸡胚肺的单轴分支。发展动力学241（2012年3月），852-862·doi:10.1002/dvdy.23771 [15] 达格马尔·伊伯和菲利普·杰曼。2014.数字是如何出现的&quest；-肢体发育的数学模型。出生缺陷研究C：《今日胚胎》102，1（2014），1-12。内政部：http://dx.doi.org/10.1002/bdrc.21057 ·数字对象标识代码：10.1002/bdrc.21057 [16] Dagmar Iber和Denis Menshykau。2013.分枝形态发生的控制。开放生物学3，9（2013），130088。内政部：http://dx.doi.org/10.1098/rsob.130088 ·Zbl 1369.92064号 ·doi:10.1098/rsob.130088 [17] 达格马尔·伊伯（Dagmar Iber）、西蒙·田中（Simon Tanaka）、帕特里克·弗里德（Patrick Fried）、菲利普·杰曼（Philipp Germann）和丹尼斯·门什科（Denis Menshykau）。2015.模拟组织形态发生和信号传递。《分子生物学方法》1189，第21章（2015），斯普林格出版社。323–338. [18] 达格马尔·伊伯和罗尔夫·泽勒。2012.对脊椎动物肢体发育进行基于感知数据的模拟。遗传学的当前观点；开发22，6（2012年12月），570–577。 [19] F.拉撒路和A.韦鲁斯。1998.三维变态：一项调查。可视化计算机14（1998），373–389·数字标识代码：10.1007/s003710050149 [20] Denis Menshykau、Pierre Blanc、ErkanÜ；纳尔、文森特·萨宾和达格马尔·伊伯。2014.几何形状和信号的相互作用使肺分支形态发生强劲。发展141，23（2014年12月），4526–36。DOI:10.1242/dev.116202·doi:10.1242/dev.116202 [21] 丹尼斯·门什科和达格马尔·伊伯。2012.用comsol模拟器官发生：相互作用和变形域。2012年COMSOL会议记录。 [22] 丹尼斯·门什科和达格马尔·伊伯。2013.基于配体受体的图灵机制控制下的肾分支形态发生。物理生物学10，4（2013年6月），046003。 [23] 丹尼斯·门什科（Denis Menshykau）、康拉丁·克莱默（Conradin Kraemer）和达格马尔·伊贝尔（Dagmar Iber）。2012.肺发育早期的分支模式选择。普洛斯计算生物学8，2（2012年2月），e1002377。 [24] Luis G.Morelli，Koichiro Uriu，Saú；l Ares和Andrew C.Oates。2012.发展模式的计算方法。《科学》3366078（2012年4月），187-191·Zbl 1355.92013年 ·doi:10.1212/科学1215478 [25] 安德鲁·奥茨（Andrew C.Oates）、妮可·戈芬基尔（Nicole Gorfinkiel）、马科斯·冈萨雷斯-盖坦（Marcos Gonzalez-Gaitan）和卡尔·菲利普·海森堡（Carl-Philipp Heisenberg），2009年。发育生物学中的定量方法。《自然评论遗传学》第10、8期（2009年8月），第517–530页·doi:10.1038/nrg2548 [26] 西蒙·普罗布斯特（Simone Probst）、康拉丁·克莱默（Conradin Kraemer）、菲利普·德莫金（Philippe Demougin）、拉西克什·谢斯（Rushikesh Sheth）、盖尔·马丁（Gail R.Martin）、西拉托（Hidetaka Shiratori）、滨田浩史（Hiroshi Hamada）、达格马尔·伊伯（Dagmar Iber）、罗尔夫·泽勒（Rolf Zeller）和艾姆（Aimé）；e祖尼加。2011年。SHH通过AER-FGF信号增强CYP26B1介导的维甲酸清除，从而促进远端肢体芽的发育。发展138，10（2011年5月），1913-1923。 [27] Ian Sigal、Michael R.Hardisty和Cari M.Whyne。2008.特定样本有限元建模的网格变形算法。《生物力学杂志》41，7（2008），1381-1389·doi:10.1016/j.jbiomech.2008.02.019 [28] Simon Tanaka和Dagmar Iber。2013.长骨发育模型中的相互依赖组织生长和图灵模式。物理生物学10，5（2013年10月），056009。 [29] 皮埃尔·特迪曼。2002.OPCODE冲突检测库。检索自http://www.codercorner.com/Opcode.htm。 [30] 阿兰·图灵（Alan M.Turing），1952年。形态发生的化学基础。伦敦皇家学会哲学学报B237（1952），37-72·Zbl 1403.92034号 ·doi:10.1098/rstb.1952.0012 [31] 奥尔特鲁德·沃特利克（Ortrud Wartlick）、安娜·基切娃（Anna Kicheva）和马科斯·冈萨雷斯-盖坦（Marcos Gonzalez-Gaitan）。2009.形态梯度形成。《冷泉港生物学展望》1、3（2009年9月），a001255。 [32] Ortrud Wartlick、Peer Mumcu、Anna Kicheva、Thomas Bittig、Carole Seum、Frank Jü；licher和Marcos Gonzalez-Gaitan。2011.Dpp信号转导和扩散控制的动态。《科学》331，6021（2011年3月），1154–1159·数字对象标识代码：10.1126/science.1200037 [33] 刘易斯·沃尔珀特。位置信息和细胞分化的空间模式。理论生物学杂志25,1（1969年10月），1-47·doi:10.1016/S0022-5193（69）80016-0 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。