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用随机折叠过程建模断裂融合桥循环的演化空间。 (英语) Zbl 1337.92159号

小结:当DNA的断裂片段被复制并且每个拷贝的末端连接在一起时,癌症中的断裂融合桥循环就会出现。然后,这种结构“展开”成一段新的回文DNA。这是癌症基因组数据中观察到的局部扩增子的机制之一。在这里,我们详细研究了断裂融合桥结构的演化空间。我们首先考虑该空间的二维树离散表示,以证明存在(2^{frac{n(n-1)}{2}})性质不同的演化,涉及(n)断裂-融合-桥循环。其次,我们考虑该过程的随机性,以表明这些演变的可能性并不相等,并描述了放大子是如何局部化的。最后,我们通过从原发组织癌样本中推断断裂-融合桥周期的演变来强调这些方法。

MSC公司:

92D20型 蛋白质序列、DNA序列
60G99型 随机过程
92D15型 与进化有关的问题
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全文: 内政部

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