帕克,米扬;特雷弗·哈斯蒂 检测基因相互作用的惩罚logistic回归。 (英语) Zbl 1274.62853号 生物统计学 9,第1期,30-50页(2008年). 小结:我们建议使用带有L_2正则化的logistic回归(LR)变体来拟合基因-基因和基因-环境相互作用模型。研究表明,许多常见疾病受某些基因的相互作用影响。具有二次惩罚的LR模型不仅正确地描述了影响基因及其相互作用结构,而且在处理具有二元响应的高维离散因子方面也产生了额外的好处。我们说明了使用L_2正则化方案的优点,并将其与“多因素降维”和“FlexTree”这两种最新的识别基因-基因相互作用的工具的性能进行了比较。通过模拟和实际数据集,我们证明了我们的方法在识别交互结构和预测精度方面优于其他方法。此外,我们通过bootstrap分析验证了所选因素的重要性。 引用于26文件 MSC公司: 62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析 92D10型 遗传学和表观遗传学 关键词:离散因子;基因相互作用;高维的;逻辑回归;\(L_{2}\)-正则化 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{M.Y.Park}和\textit{T.Hastie},生物统计学9,第1期,30-50(2008;Zbl 1274.62853) 全文: DOI程序