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CTRL:CTL的扩展,带有正则表达式和公平操作符,用于验证遗传调控网络。 (英语) Zbl 1231.68163号

本文提倡使用形式化方法,特别是模型检查,来分析生物系统的行为。为此,它引入了著名的分支时间时序逻辑CTL的一种变体,并用正则表达式和公平操作符进行了扩展,并显示了({i})如何对该逻辑的公式进行模型检查,以及({ii},)这如何有助于生物系统的分析。
第一个方面涉及的篇幅太长。到目前为止,有几个使用正则表达式的CTL扩展(通常由第一作者在文章中介绍),而使用公平运算符的扩展早已为人所知。本文中有大量篇幅致力于将这种新逻辑转换为一些模型检查器内部使用的规范形式。目的并不能证明这种努力是正当的。据说,新逻辑是专门为生物系统规范中出现的要求而设计的。因此,与CTL的其他扩展相比,在那里了解更多关于它的使用以及彻底了解它会更好。模态方程系统的翻译——模态演算的一种符号变体——对想要分析生物系统的人来说兴趣不大。因此,只要将其清晰地转换为模态\(\mu\)演算的标准表示,并暗示该逻辑有模型检查器就足够了。此外,它似乎使用J.A.布尔佐夫斯基的衍生品[J.ACM 11,481–494(1964;Zbl 0225.94044号)]这样就不需要一些特别的确定程序,而这些程序的正确性目前尚不清楚。

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60年第68季度 规范和验证(程序逻辑、模型检查等)
92立方厘米 系统生物学、网络
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